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2015《转录组学数据分析专题》培训

2015《转录组学数据分析专题》培训

时间:2015-03-09 08:00:00 至 2015-03-11 18:00:00结束
地点:北京 北京市计算中心 海淀区丰贤中路7号

发布时间:2015-03-02 10:44:09

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推荐参加: 2017第二届化学与生物化学工程国际会议(CHEMBIO2017) (时间:2017-05-23 地点:西安 )

会议报名

门票名称单价(¥)截止时间数量
会务费 费用说明 暂无说明3000.002015-03-11

会议通知
Meeting notice

近年来,随着高通量测序技术的迅猛发展,转录组研究从以前的微阵列技术,SAGE及MPSS技术的低通量模式切换至RNA-seq的高通量模式。转录组学作为一个伴随高通量测序技术率先发展起来的技术开始在生物学前沿研究中得到了广泛的应用。

RNA-seq对于真核生物的基因表达调控,癌症等疾病的发生机制和新治疗方案确定,遗传育种等众多方面的研究具有不可估量的潜力。为了辅助广大科研工作者掌握转录组高通量测序技术原理、实验设计以及后期数据分析技能,北京市计算中心生物计算事业部举办“转录组学”培训研习班。

主办单位】   北京市计算中心、中国生物工程杂志


 

 

会议日程
Meeting schedule

本次课程时间: 上午:9:00-11:30下午:13:30-17:00

日期

授课题目

授课内容

第一天

转录组测序与数据分析

转录组基本概况和技术发展简介

转录组技术流程及技术细节(重点讲解)

转录组应用案例

转录组数据分析实例(上机操作)

1、linux基础
掌握Linux系统下的常用命令(重点)
掌握linux环境下软件的安装使用
了解shell脚本的编写
2、转录组数据准备和软件介绍

转录组数据的比对(重点讲解)、表达量估计和分析(重点讲解)

第二天

转录组组拼接及功能注释

1、转录组序列拼接的技术方法

2、常用软件及转录组个性化组装的技巧

3、使用R语言相关的软件包对转录组学的高通量测序数据进行分析。

讲解差异表达分析,GO分析,Pathway分析,聚类分析等。

4、讲解如何绘制表达量的热图等

转录组拼接组装(上机操作)

1、转录组组装的流程介绍

2、原始测序数据的预处理

3、介绍Trinity的使用,并以测试测序数据为例进行组装

4、介绍cdhit的是使用,并以测试组装结果为例进行聚类

5、介绍寻找ORF的方法

第三天

microRNA测序与数据分析

1、microRNA目前的应用、发展历史以及microRNA的定义

2、microRNA的生物学过程(重点讲解)

3、microRNA的测序(重点讲解)

4、microRNA测序数据分析软件(重点讲解)

5、microRNA目前的挑战以及将来的研究前景

6、microRNA测序数据分析案例展示(重点讲解)

7、近期文献

microRNA数据分析实例(上机操作)

1、microRNA测序数据预处理(重点讲解)

2、测序数据长度分布计算

3、microRNA的预测(重点讲解)

4、microRNA碱基偏好性计算

5、microRNA靶标基因预测,结果提取、统计(重点讲解)

(课程内容以实际授课为准)

会议门票
Meeting ticket

3000元/人(含听课费、资料费、上机费,请自带笔记本电脑以备上机实践使用)。

报名优惠政策

1、开课前10天报名的学员每人可减少100元;2、3人以上团体报名每人可减少400元;3、4+1团报,可免费赠送一个名额;

备注:上面3种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。


标签: 生物工程 生物学 转录组 生物化学

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