主要从事热带海洋生物的研究，重点开展珊瑚礁生物、微藻类的工作。在珊瑚礁方面，以珊瑚病害、繁殖、生态修复为特色，在微藻方面，主要进行雨生红球藻的培养和虾青素的研发。是一个以学术科研为基础，以生态保护为目标的踏实实干的公益性科研机构。此外，还进行赤潮、生态调查，鱼类、贝类、大型藻类的繁殖、培育等研究与开发。
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