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首页 > 商务会议 > 医疗医学会议 > TCGA、GEO及SRA公共数据库深度挖掘与应用培训班2019(4月北京班) 更新时间:2019-01-31T14:39:26

TCGA、GEO及SRA公共数据库深度挖掘与应用培训班2019(4月北京班)
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TCGA、GEO及SRA公共数据库深度挖掘与应用培训班2019(4月北京班)

会议时间:2019-04-12 09:30至 2019-04-15 17:00结束

会议地点: 北京  北京市计算中心  海淀区丰贤中路7号

会议规模:暂无

主办单位: 中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会

发票类型:增值税普通发票 增值税专用发票

会议介绍

会议内容 主办方介绍


TCGA、GEO及SRA公共数据库深度挖掘与应用培训班2019(4月北京班)

TCGA、GEO及SRA公共数据库深度挖掘与应用培训班2019(4月北京班)宣传图

当今,生物医学大数据的产出已经非常庞大,利用这些公共数据资源并融入自己的构想,然后分析解决生物学问题将是以后的关键,也是目前科研的热点。各种公共数据库呈井喷式发展,如TCGA、GEO和SRA。TCGA(癌症基因组图谱)是全球最大的癌症基因信息数据库,是一个多组学的数据库,包括常见癌症的基因组、转录组、蛋白组、表观遗传组数据和与其关联的临床数据,为挖掘有意义的组学变化和发现肿瘤发生、发展、转移等生物学机制提供了海量数据。GEO数据库是当今最大、最全面的公共基因表达数据资源。不仅可以上传自己的数据,而且还可以免费下载数据库中和自己研究方向类似甚至相同的数据来进行分析,为自己的研究提供一些启示或者验证。SRA是NCBI上常用的一个数据库。它接受通过二代测序技术产生的遗传学数据以及与其相关的质控报告。但是面对这些极其有价值的公共数据时,科研人员往往心有余而力不足,而且面对市面上的浩如烟海的各类教程也是一头雾水。本次培训提供了一次系统了解TCGA等数据产生,分析及挖掘的课程,帮助科研人员利用这些公共数据库挖掘多组学数据,以便为自身科研项目服务。 

授课对象:从事肿瘤研究的临床医生、转化研究科研人员、在校研究生以及广大临床肿瘤研究领域的爱好者。 

主办单位:中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会 

承办单位:北京市计算中心

协办单位:云计算关键技术与应用北京市重点实验室、中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会 、北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心 、中国生物工程杂志 、北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司 、深圳微生太科技有限公司 、北京依托华茂生物科技有限公司

举办地点:北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼,北京市计算中心会议室 

举办时间: 2019.4.12-15(报名中)上午930-12:00下午13:30-17:00.

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中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会 中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会

中国生物工程学会(Chinese Society of Biotechnology,CSBT)成立于1993年,首任理事长:谈家桢院士,现任理事长:高福院士。中国生物工程学会成立以来,主办、承办、协办了多个国际、国内学术交流活动,为促进生物技术与生物产业发展、提高国民素质、促进经济和社会发展等方面发挥了重要作用。

会议日程

(最终日程以会议现场为准)


日期

时间

授课题目

授课内容

第一天

上午

Linux操作基础及常见命令

1、Linux系统操作

2、基本上机命令

下午

R语言基础及实操

1、R语言简介

2、R基本数据结构,各种软件包下载和安装

3、R编程基础及语句判断

第二天

上午

SRA数据库介绍及使用

1、数据挖掘概述;

2、高通量组学研究基础知识;

3、SRA数据库在线工具的应用;

4、SRA数据上传与下载

下午

GEO数据库介绍及使用

1、GEO在线工具的应用;

2、GEO数据下载和数据质量分析;

3、GEO芯片数据处理

第三天

上午

TCGA数据库介绍及使用

1、TCGA数据库基本概念介绍及数据获取

2、操作实战: TCGA数据获取,不同类型数据的使用

3、基于发表文章的TCGA数据分析作图实例

下午

TCGA及生物网络调控分析

1、基因表达谱的PPI网络挖掘

2、利用cytoscape进行miRNA-mRNA互作网络、蛋白质-蛋白质互作网络上机操作

第四天

上午

公共数据库挖掘文献解析1

1、基于TCGA和GEO数据挖掘文章的深度解析及复现(结合具体实例);

2、如何做成发表文章中的图表

下午

公共数据库挖掘文献解析2

1、经典文献解析及复现;

2、如何利用TCGA和GEO进行数据挖掘及临床转化课题设计

 (课程内容以实际授课为准)

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会议嘉宾


即将更新,敬请期待

参会指南

会议门票 场馆介绍


报名费用】 

注册费:3000元/人,包括学费、材料费、午餐费等。请自带笔记本电脑。 材料:《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社。

【报名优惠政策】 

1、2019.3.18日前报名并缴费,可享受减免200元优惠。 
2、3人以上团体报名每人可减少300元; 
3、4+1团报,可免费赠送一个名额; 
4、上面3种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。

老学员参加及推荐学员参加均可额外优惠200元。
培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。 

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北京市计算中心 北京市计算中心

北京市计算中心建立于一九七三年,是国内最早一批计算中心之一,是中国最早、最具影响力的从事计算机应用技术研究及推广的机构,服务对象则涉及工业、商业、交通、能源、环保金融、税务、社会事务等多个领域。北京市计算中心自成立以来,完成了上百项国家和北京市政府有关部门委托的研究项目和面向多种用户的服务型项目。先后获得国家及省部级成果奖30多项、,拥有了200余项国际国内领先的技术和产品,为中国计算机的普及、应用和发展做出了杰出贡献

温馨提示
酒店与住宿: 为防止极端情况下活动延期或取消,建议“异地客户”与活动家客服确认参会信息后,再安排出行与住宿。
退款规则: 活动各项资源需提前采购,购票后不支持退款,可以换人参加。

会议支持:

  • 会员折扣
    该会议支持会员折扣
    具体折扣标准请参见plus会员页面
  • 会员返积分
    每消费1元累积1个会员积分。
    仅PC站支持。
  • 会员积分抵现
    根据会员等级的不同,每抵用1元可使用的积分也不一样,具体可参见PLUS会员页面。 仅PC站支持。

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部分参会单位

主办方没有公开参会单位

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