成立于1958年10月1日，原名中国科学院化工冶金研究所，2001年更为现名。1998年10月29日，被中科院认定为高技术研究与发展基地型研究所。2001年4月7日，研究所正式确立学科方向为过程工程，被中国科学院确定为中国科学院第二批知识创新工程试点。 研究所研究方向为多相反应与分离过程中的新理论、新技术、新方法，重点解决生化、资源环境、材料、能源等领域中的共性、关键性问题，开发新材料、新工艺和新设备，使之工程化、工业化。
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