基因组关联分析技术应用培训班

2018年01月10日 - 01月12日
北京
¥3500 起

会议介绍

【会议内容】

以“共变法”思想为核心的关联分析是研究人类复杂疾病的主要手段,其与以“求同法”思想为核心的“序列比对(Blast)”同样重要,但方法学却复杂得多。北京市计算中心生物计算事业部,主要针对具备一定统计学、遗传学、分子生物学基础的人类医学领域研究人员,特开设基因组关联分析培训班。

主办单位:中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会

承办单位:北京市计算中心

协办单位:云计算关键技术与应用北京市重点实验室 

     中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会 

     北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心 

     中国生物工程杂志 

     北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司

    北京微生太科技有限公司 

举办地点:北京,北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼

培训时间2018.1.10-12  上午9:30-12:00,下午13:30-17:30


【培训特色】
无需任何计算机语言基础
深入简出,内容精要实用
结合人类医学、动植物育种等生物学数据背景知识与实例讲授
统计学原理+模型/算法+编程实现+生物医学应用
边学边练,重实践,力求实效
小班授课,个别辅导

【会议日程】

日期

授课题目

授课内容

第一天

基因组关联分析理论基础

  1. 基因组学与生物信息学概述;
  2. 基于群体遗传的数据获取;
  3. 基因组关联分析的原理、数模、策略及常用软件介绍;
  4. 常用GWAS数据库介绍;

Plink软件基础应用

  1. Plink软件应用;
  2. Plink文件格式生成与解析;
  3. 等位基因频率计算;

8、 哈-温平衡计算;

9、 目标区域数据提取;

10、 基因组关联分析流程;

11、     关联分析结果分析与p校正;

第二天

基因型填充Imputation

12、 基因型填充Imputation的原理及应用;

13、 Beagle软件介绍与应用;

14、 基因组填充的方法与分析流程;

15、 1000G数据应用

Plink软件进阶应用

16、 基于家系的关联分析;

17、 曼哈顿图的绘制与结果展示;

18、 SNP位点的condition分析;

19、     Meta gwas数据分析;

第三天

Haploview软件

20、 Haploview软件应用;

21、 Haplotype单倍型分析;

22、 LD连锁不平衡指数计算;

23、 SNP marker之间的r2、D值等计算;

Tassel软件

  1. Tassel软件应用;
  2. Tassel基于命令行的批量数据分析;
  3. 生物多样性指数、PCA、遗传距离计算等;

  (课程内容以实际授课为准)

【会议门票】

注册费:3800元/人(含听课费、资料费(材料:《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社。)、上机费、午餐,请自带笔记本电脑以备上机实践使用)。  

【报名优惠政策】
1、12.20日前报名并缴费,可享受减免300元优惠;
2、3人以上团体报名每人可减少400元;
3、4+1团报,可免费赠送一个名额
4、上面3种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。
培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。

拟邀嘉宾

猜你喜欢