生物信息培训：数据分析与R语言制图专题研讨班

日期

等级

授课题目

授课内容

第一天

基础

R语言基础知识

• R语言概述及特点

• R语言软件安装和功能介绍

• R语言包的安装和帮助文档

R语言的编程

• 介绍R语言中常用的数据结构（包括向量，数组，矩阵，列表，数据框等）的介绍和操作方法；

• R语言中数据的导入导出

• R语言编程中常用的控制语句；

• R语言中功能模块（函数）的编写和使用方法。

第二天

实战

R绘图基础

• R绘图的基本概念和模式

• R语言中常用绘图函数和绘图参数的介绍

• 使用专门的绘图包进行绘图

ggplot2的使用

• ggplot2软件包概述

• ggplot2绘制简单图形

• ggplot2绘制复杂图形，并进行参数调整

第三天

R在统计学中的应用

• 使用R做统计分析，假设检验，包括常用的参数和非参数检验；

• 使用线性模型进行回归分析；

• 使用R做方差分析；

• 使用R做主成分分析和聚类分析等

• （以生物、医学和生态相关内容为例）

第四天

高级

R在生物信息学分析中的应用

• 使用R语言分析转录组测序的read count数据，进行差异表达分析；

• 使用R进行基因的GO富集分析和Pathway分析等。

课堂答疑

• 具体问题讨论和现场答疑，可以结合学员自身数据和分析需求，设计和编写R语言脚本