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首页 > 培训课程 > 生物/医学培训 > 宏基因组与代谢组学R语言分析及可视化实操研讨会8月培训 更新时间:2022-07-28T11:01:10

宏基因组与代谢组学R语言分析及可视化实操研讨会8月培训
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宏基因组与代谢组学R语言分析及可视化实操研讨会8月培训

课程时间: 2022-08-27 09:00至 2022-08-27 18:00结束

课程地点: 线上活动 

主办单位: 上海循掘生物科技中心

门票名称单价截止时间数量
会务费 暂无说明 ¥1500.0 2022-08-26 17:00

会议介绍

会议内容 主办方介绍


宏基因组与代谢组学R语言分析及可视化实操研讨会8月培训

宏基因组与代谢组学R语言分析及可视化实操研讨会8月培训宣传图

宏基因组代谢组学R语言分析及可视化实操研讨会

2022年8月27日 腾讯会议网络会议室

背景介绍

微生物是自然界中分布最广、种类最多、数量最大的生物类群。以肠道微生物为例,人体内微生物的总数量约是人体细胞总数的10 —— 越来越多的研究发现,肠道微生物与人体健康有着密切的关系,而微生物产生的代谢物是调控过程中最主要的中间递质之一。
宏基因组研究包括16s测序和宏基因组测序,可以获得微生物群落丰度以及组成。通过分析可以获得关键菌群以及功能,为疾病治疗提供研究基础。

代谢组学是基于LC-MS/MS液质联用技术对生物样本中的小分子代谢物进行定性和相对定量分析。

宏基因组-代谢组的联合分析能够从多个维度阐释一个科学问题可以用来解释差异菌群与差异代谢物的关联性,从而帮助建立微生物-代谢物-表型之间的逻辑关系

基于以上原因医药加推出宏基因组+代谢组联合分析R软件实操课程,带您充分挖掘数据,掌握生信高级分析能力。


主要内容详细内容见下文日程表

  1. 宏基因组生信文章解读与报告解读;
  2. RRstudio软件安装,宏基因组与代谢组学联合分析实操;
  3. 生信SCI文章实用数据处理与图片导出。


【会议预期】

通过一天的时间学习数据处理分析及可视化作图,得到SCI水平的图片。

讲师简介

宋伟博士

成果:参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建;完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。

研究方向:有近十年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perl、R等编程语言。

培训经历:在上海、北京、广州、沈阳、南京等城市举办过几十场现场培训班。


主办方:上海循掘生物科技中心

会议时间20228月27

会议地点线上:腾讯会议网络会议室

收费标准:会务费:线上:1500/人;

优惠政策:

1.提前确认报名及转账的,可以提前拿到学习材料

2.三人组团报名,每人优惠100元

3.四人组团报名,每人优惠200元,

4.人组团报名缴费,可免1人会务费

可以开正规会务发票,纸质邀请函(盖红章)。


注意事项:必须携带win10以上系统的电脑,现场不得录音录像。上课软件为R和Rstudio。




会议日程


宏基因组与代谢组学R语言分析及可视化会议日程

时间安排

课程表

介绍

上午

9:00 -10:15

生信分析思路及测序标准报告解读

  1. 生信简介;
  2. 宏基因组生信文献解读;
  3. 宏基因组与其他组学整合文献解读;
  4. 16s测序分析报告解读;
  5. 宏基因组测序分析报告解读;
  6. 代谢组分析报告解读;

10:30-12:00

R语言基础

  1. R软件与Rstudio软件安装;
  2. R基础类与对象(元素、向量、矩阵);
  3. R基础函数;
  4. R基础路径修改、文件导入、导出图表;
  5. R基础—R包及安装


下午

13:30 -15:15

宏基因组及代谢组数据生信分析R实操演示

  1. α多样性箱线图;
  2. β多样性PCoA分析;
  3. 物种组成柱状图;
  4. 物种热图分析
  5. LeFse分析树形图分析。
  6. 无监督PCA分析;
  7. PLS/DA分析
  8. Limma差异分析计算logFCp值;
  9. 火山图与差异基因热图;
  10. 功能气泡图
  11. 16s与代谢组整合共表达分析
  12. 桑基图分析。

15:30 - 17:15

数据库及在线工具实操

  1. Venn图在线工具;
  2. KEGG 数据库;
  3. metaboAnalyst数据库;

17:15- 17:30

答疑








示例图展示


宏基因组与代谢组学R语言分析及可视化实操研讨会8月培训

示例图 箱线图

宏基因组与代谢组学R语言分析及可视化实操研讨会8月培训

示例图 PCoA

宏基因组与代谢组学R语言分析及可视化实操研讨会8月培训

示例图 物种组成柱状图

宏基因组与代谢组学R语言分析及可视化实操研讨会8月培训

示例图 热图


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示例图 venn

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示例图 PCA分析

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示例图 Lefse树状图


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上海循掘生物科技中心

上海循掘生物科技中心于2020年2月21日举办TCGA&GEO生信高通量数据挖掘分析研讨会2020(2月深圳班)会议。

会议日程


即将更新,敬请期待

会议嘉宾


即将更新,敬请期待

参会指南

会议门票


票种名称 价格 原价 票价说明
会务费 ¥1500 ¥

查看更多

温馨提示
酒店与住宿: 为防止极端情况下活动延期或取消,建议“异地客户”与活动家客服确认参会信息后,再安排出行与住宿。
退款规则: 活动各项资源需提前采购,购票后不支持退款,可以换人参加。

还有若干场即将举行的 宏基因组大会

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会议地点

部分参会单位

主办方没有公开参会单位
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