生物标志物与液体活检论坛

【会议日程】

嘉宾	单位	演讲题目
5月20日 上午
陈杰	北京协和医院	非编码RNA生物标志物研究（暂定）
张剑宁	海军总医院	原发性中枢神经系统淋巴瘤活检与生物标志物研究进展
何农跃	东南大学生物医学工程学院生物电子学国家重点实验室	基于磁分离的高通量分子标志物检测与筛查研究
宋现让	山东大学附属山东省肿瘤医院	外泌体研究进展
5月20日 下午
张学工	清华大学	用统计和机器学习进行基因差异表达分析：从基因芯片到RNA测序到单细胞测序
安建雄	中国医大航空总医院	临床医生转化医学：路在脚下
李海洋	中科院大连化学物理研究所	Online and Real-time analysis of Volatile Biomarkers by High-Pressure Photon Ionization Mass Spectrometry
孙英丽	中国科学院北京基因组研究所	Y染色体上特异DNA甲基化位点作为前列腺癌无创液体诊断标记的研究
5月21日 上午
康静波	海军总医院	肿瘤放疗相关的生物标志物（暂定）
王秋泉	厦门大学	元素稳定同位素标记策略与生物标志分子和细胞的分析方法学
王晓良	中国医学科学院药物研究所	蛋白组学生物标志物（暂定）
朱小立	上海大学	循环肿瘤细胞无损分析新方法的研究
5月21日 下午
刘秀华	解放军总医院	心血管疾病相关生物标志分子：钙网蛋白的研究进展
陈洛南	中国科学院上海生命科学研究院	基于动态网络标志物的“未病”检测理论和方法
文路	北京大学生物动态光学成像中心	循环游离DNA甲基化组测序新技术MCTA-Seq及其在肿瘤早期诊断中的应用

【大会内容】

生物标志物是一种能客观测量并评价正常生物过程、病理过程或对药物干预反应的指示物，在疾病诊断、治疗、以及疗效监测等方面发挥着重要作用。

近年来随着免疫学、分子生物学和基因组学技术的发展，寻找和发现有价值的生物标记物已经成为研究的一个重要热点。基因组学、蛋白质组学、代谢组学等多种手段带来了多样化的生物标志物，除了传统的生物标志物，近年来，可用于液体活检的生物标志物成为热门，液体活检主要包括血浆游离循环肿瘤DNA（ctDNA）、循环肿瘤细胞（CTC）、外泌体检测等，外泌体是液体活检的新兴方向，目前对ctDNA和CTC研究较多。2016年1月，国家食品药品监督管理局批准了首个CTC检测试剂盒，液体活检技术正式应用于临床。而且，除经典的血液中的蛋白质标志物外，目前越来越多从各种体液（如唾液，汗液，尿液等）、人体微生物组中拓展发现生物标志物。

本次会议将重点关注各类生物标志物的检测、疾病的生物标志物研究、生物标志物在药物开发中的作用、多种液体活检手段在生物标志物检测中的应用等，讨论生物标志物在精准医疗中的重要作用，为科研工作者和临床医生提供交流合作的平台。

主要议题

【会议嘉宾】

安建雄

中国医科大学航空总医院

医学博士，主任医师，博士导师。中国医科大学航空总医院副院长、麻醉与急重症医学科（ICU）主任，疼痛医学中心主任；中国科学院北京转化医学研究院执行院长，兼带状疱疹后神经痛研究室，股骨头坏死研究室（筹）主任。美国匹兹堡大学麻醉与疼痛医学系助理教授（adjunct assistant professor），中国科学院大学兼职教授。中华医学会麻醉分会疼痛诊疗培训基地主任。潍坊医学院北京临床学院副院长 。  

研究方向：

各种危重疑难病例麻醉、抢救与治疗。分别于2013年和2014年成功完成“渐冻人”吕元芳和著名运动员桑兰剖宫产麻醉与重症监护治疗。近年来，成功攻克世界公认医学难题“带状疱疹后神经痛”。此外，安建雄博士在股骨头坏死、严重抑郁自杀倾向、脊髓损伤及脊髓炎性疼痛、肠激惹综合症及神经介入治疗等方面也卓有建树。

科研成果：

发表论文90篇，以第一或通讯作者发表SCI收录论文20篇，影响因子累计>40。先后承担国家卫生部、北京市、清华大学、美国匹兹堡大学、部级重点学科建设及中国科学院脑功能与认知科学国家重点实验室开放基金，国家自然科学基金等研究项目，目前从事疼痛机制和认知功能研究。主编《临床疼痛治疗学》和《临床疼痛病案分析》，参编著作10余部。

工作经历：

1999年留学英国牛津大学Churchill Hospital疼痛中心；
1996-2000年任中国医学科学院阜外心血管病医院麻醉科疼痛专业主管；
2001-2004年留学美国匹兹堡大学麻醉学系和疼痛医学中心；
2005-2011年清华大学麻醉与疼痛医学科主任。

陈洛南

中国科学院上海生命科学研究院

中国科学院上海生命科学研究院系统生物学重点实验室执行主任、研究员。中国运筹学会《计算系统生物学分会》理事长，IEEE-SMC《系统生物学委员会》主席，中国细胞生物学会《功能基因组学与系统生物学分会》副会长，中国药理学会《网络药理学专业委员会》副主任委员。近年来，陈洛南在计算系统生物学和复杂疾病研究领域发表了270篇以上SCI期刊论文及10部以上专著及编著书籍。

基于动态网络标志物的“未病”检测理论和方法：

众多的证据表明，许多复杂生物过程存在一种普遍临界现象，即由一个相对稳定状态，经过一个临界点后在很短的时间内快速地进入另一个稳定状态。如许多复杂疾病的恶性转化就是这样的一种普遍现象，即病情在很短的时间内从正常状态（包括健康状态、相对稳定状态或疾病的缓慢变化状态），经过一个临界点或关键节点快速进入疾病状态（包括疾病恶化状态）。为了探测这种突变现象及其关键因子，我们提出了动态网络标志物（dynamical network biomarker, DNB），即利用高通量生物数据的动态性质来预测复杂疾病或复杂生物过程临界突变现象及其关键因子的概念和理论。不同于传统的、主要用于检测疾病状态的分子生物标志物，DNB是一种全新的、用于探测疾病突变前临界信号的生物标志物，即检测“前疾病状态”而不是“疾病状态”或“疾病早期状态”。DNB具有诸多的优点特征：首先，不需要建立任何模型，是一个model-free的方法；第二，DNB可以在小样本条件下获得疾病突变前的预警信号；第三，DNB是突破稳定状态首先进入疾病状态的主导分子群或生物分子的子网络，即为疾病的主导分子群或关键网络而不是疾病所影响的分子群，因此具有非常重要的生物学意义。我们进一步成功地应用DNB到肺损伤及癌症的前疾病状态和关键因子群的检测。

研究方向：

计算系统生物学及网络生物学

学习和工作经历：

1984年获华中科技大学电气工程学士学位；
1988年获日本东北大学系统科学硕士学位；
1991年获日本东北大学系统科学博士学位。
1997年起任日本大阪产业大学副教授；
2000年起任美国加州大学洛杉矶分校(UCLA)访问教授；
2002年起任日本大阪产业大学教授；2007年筹建上海大学系统生物技术研究所并首任所长（兼）；
2009年4月起任日本东京大学（兼）研究教授；
2009年10月至今任中科院系统生物学重点实验室执行主任，研究员，博士生导师，研究组组长。

康静波

海军总医院

现任肿瘤诊疗中心主任，主任医师，教授，医学硕士，硕士研究生导师。作为主编参编3部著作，作为副主编参编5部著作，另参编15部专业著作的编写工作。作为第一作者发表论文30余篇，另作为第一作者发表SCI论文2篇；承担中华国际交流基金2项，参与全军后勤科研重点课题1项，承担科技部“十二五”分配的子课题1想；获全军科技进步二等奖一项，山东省科技进步二等奖一项，全军医疗成果二等奖一项，全军医疗成果三等奖3项。专长：各系统恶性肿瘤的综合治疗，从事放射肿瘤学专业20余年，熟练掌握及精通各类肿瘤的放射治疗临床技术及化疗应用，擅长头颈部肿瘤的放射治疗临床工作、全身伽玛刀的临床工作、射波刀治疗的临床工作。任：中国生物医学工程学会精确放疗专业委员会 主任委员 全国肿瘤精确放疗技术学科首席科学传播专家 中国肿瘤微创治疗联盟立体定向委员会 主任委员 国际立体定向放射外科协会（ISRS） 委员 全军放射肿瘤学会 常务委员, 全军放射物理技术专业分会 副主任委员 中国医学装备协会常务理事 世界中医药协会疼痛康复委员会副会长 北京抗癌协会放疗专业委员会委员 北京医师协会放射治疗医师（技师）分会理事 中国医学装备协会放疗装备与技术分会 委员 中国大型医疗设备上岗正培训 专家 中国装备医学杂志编委、癌症进展杂志编委， 山东医药杂志编委、慢性病学杂志编委。

刘秀华

解放军总医院

北京医科大学医学博士，解放军总医院老年医学（心血管病专业）博士后，挪威Oslo大学博士后、客座教授。享受国务院政府特殊津贴和军队优秀专业人才津贴。 现任中国人民解放军总医院病理生理研究室、 临床微循环中心主任，博士生导师，研究员。
近年获得国家自然科学基金重大国际合作项目、863、973和国家重大新药创制等在内的项目16项，发表论文160余篇，主研的《冠心病缺血心肌保护及其机制研究》、《心肌缺血再灌注损伤的机制及其防治研究》等项目获军队及省部级科技进步二等奖6项，三等奖6项，荣立三等功1次。培养博士后1名，博士研究生12名，硕士研究生16名。

研究方向：

从事冠心病、高血压及微血管病的发病机理研究与临床工作。负责解放军总医院高血压门诊和微循环门诊的日常诊疗工作，对心血管疾病的诊治及其发病机制有丰富的经验及独到的见解，尤其在高血压病、冠心病和微血管病治疗领域具有扎实的功底和临床经验。

学习和工作经历：

1978.2 — 1982.12 青岛医学院医学系 学士学位
1983.2 — 1984.1 山东医科大学病理生理学教研室 进修
1994.9 — 1997.7 北京医科大学病理生理学专业 博士研究生
1997.8 — 1999.7 解放军总医院临床（老年）医学博士后 副教授
1998.2 — 1999.7 挪威奥斯陆大学实验医学 博士后
1999.8 —现在 解放军总医院病理生理学研究室 副研究员、研究员。

宋现让

济南大学山东省医学科学院/山东省肿瘤医院

博士，研究员，山东大学博士生导师，济南大学（山东省医学科学院）肿瘤学博士生导师，检验医学专业硕士生导师。现任山东省肿瘤医院院长助理，兼检验科主任和山东省放射肿瘤学重点实验室常务副主任。
近年来承担省部级以上科研课题16项，包括国家自然科学基金、国家“863”计划、卫生部行业科研专项、国家科技支撑计划、山东省科技攻关，山东省自然基金重点项目等。发表论文100余篇，其中以第一作者或通讯作者发表SCI收录论文25篇。研究成果获得国家科技进步奖二等奖1项（2009年，第2位）、为首获得山东省科技进步奖二等奖、中国抗癌协会科技成果奖三等奖和山东省医学科学院科技成果奖一等奖各1项。为首获得发明专利3项。

研究方向：

肿瘤分子诊断技术，肿瘤复发和转移的机制研究

学习和工作经历：

1981-1986山东滨州医学院，医疗系，学士学位。
1987-1990 同济医科大学，微生物与免疫专业，硕士学位。
2003-2006山东大学生物化学与分子生物学，理学博士学位。
2001-2002 澳大利亚昆士兰大学，高级访问学者。
2002年被聘为研究员。

孙英丽

中国科学院北京基因组研究所

博士生导师，中国科学院精准基因组医学重点实验室“百人计划”研究员。2000年获北京大学理学博士学位。2000-2002年在麻省理工大学从事博士后研究；2002-2010年在哈佛大学医学院 Dana Farber癌症研究所先后从事助理研究员和讲师工作。曾获哈佛大学首届华人生命科学年会杰出研究奖，教育部自然科学奖一等奖，北京大学“学术十杰”等荣誉奖项。现任北京细胞生物学会理事，北京细胞生物学会青年学术委员会委员，安徽省药学会精准药物治疗专业委员会副主任委员， Genomics, Proteomics & Bioinformatics，Scholarena Journal of Genetics等杂志编委。承担国家自然科学基金委，中科院战略性A类先导专项，973课题等多项科研项目，在Nature Cell Biology、PNAS、Cell research、Ocotarget等国际学术期刊上发表论文30余篇。

演讲报告题目摘要：

Y染色体上特异DNA甲基化位点作为前列腺癌无创液体诊断标记的研究

前列腺癌是男性中最常见的恶性肿瘤之一。目前前列腺癌特异性抗原（PSA）诊断的主要缺陷是特异性较差，且常导致非必要的活检，造成患者极大痛苦。因此寻找新的灵敏性和特异性高的分子标记对前列腺癌的诊断具有重要意义。DNA异常甲基化是肿瘤中常见表观遗传变化。我们利用Illumina Infinium Human Methylation 450 BeadChip array，从癌症和癌旁样本中检测了位于Y染色体上的416个位点的甲基化水平，通过对66对前列腺癌和癌旁样本的Y染色体DNA甲基化分析对比，发现有75个位点的甲基化水平在癌旁样本间是比较保守的，其在不同个体间的甲基化水平几乎是一致的，不受年龄和地域等因素的影响。而其中6个位点在癌中发生了异常甲基化。利用前列腺癌病人的尿液样本，通过焦磷酸测序分析，我们最终筛选出了一个位点，其接受者特征曲线（ROC）分析显示，该位点前列腺癌诊断灵敏性和特异性分别达到了94.6%和78.3%，远优于传统的PSA方法，可作为潜在的前列腺癌诊断标志物，对前列腺癌的临床诊断具有重要意义。

研究方向：

主要研究方向为表观基因组的遗传规律和肿瘤表观基因组变异的功能和作用机理。重点致力于肿瘤早期诊断和靶向治疗的精准医学研究。核心内容为利用液体活检及多组学分析技术，进行恶性肿瘤相关诊疗标记物、治疗靶标的探索及靶向药物的筛选。

学习和工作经历：

孙英丽，1995年毕业于山东大学，同年考入北京大学翟中和院士研究组，2000年获北京大学理学博士学位。在学期间，先后获谈家桢基金生命科学九源奖学金一等奖、北京大学科技发明“挑战杯”二等奖、北京大学“学术十杰”、北京大学优秀博士论文一等奖、全国优秀博士论文等荣誉奖项，其作为主要完成人参与的研究工作获2005年教育部自然科学奖一等奖。
2000-2002年在麻省理工大学Robert Rosenberg教授研究组从事博士后研究，2002-2010年在哈佛大学医学院 Dana Farber癌症研究所Brendan Price研究组从事研究工作。期间，获得哈佛大学首届华人生命科学年会杰出研究奖等奖项。2010年由中国科学院北京基因组研究所引进回国，担任“百人计划”研究员，博士生导师，并获第二届“SCOPUS寻找青年科学之星” 成长奖第二名。

近期发表论文：

注：#标识的为共同第一作者，*标识通讯作者或共同通讯作者
(1) Lushuai Yao#, Shancheng Ren#, Minjie Zhang#, Fengxia Du, Yasheng Zhu, Hui Yu, Chenyu Zhang, Xiaohua Li, Caiyun Yang, Huixian Liu, Dong Wang, Hao Meng, Shuang Chang, Xiao Han, Yinghao Sun*, and Yingli Sun*, Identification of Specific DNA Methylation Sites on the Y-chromosome as biomarker in Prostate Cancer, Oncotarget, 2015, 6(38):40611-21
(2) Jian Shu#, Ke Zhang#, Minjie Zhang#, Anzhi Yao, Sida Shao, Fengxia Du, Caiyun Yang, Wenhan Chen, Chen Wu, Weifeng Yang, Yingli Sun*, Hongkui Deng*, GATA Family Members as Inducers for Cellular Reprogramming to Pluripotency, Cell Res, 2015, 25(2):169-80
(3) Fengxia Du, Minjie Zhang, Xiaohua Li, Caiyun Yang, Hao Meng, Dong Wang, Shuang Chang, Ye Xu, Brendan Price*, and Yingli Sun*, Dimer monomer transition and dimer re-formation play important role for ATM cellular function during DNA repair, Biochem Biophys Res Commun, 2014, 452(4):1034-9
(4) Lushuai Yao#, Yanyan Li#, Fengxia Du, Xiao Han, Xiaohua Li, Yuanjie Niu, Shancheng Ren, Yingli Sun*, Histone H4 Lys 20 methyltransferase SET8 promotes androgen receptor-mediated transcription activation in prostate cancer, Biochem Biophys Res Commun, 2014, 450(1):692-6
(5) Jinliang Wu, Rong Fu, Zongzhi Liu, Guochao Li, Xiaolei Huang, Yang Xue, Yan Xu, Yingli Sun*, Jiangmin Zhao*, Jun Mi*, Cell proliferation downregulated by TGF-β2-triggered G1/S checkpoint in clinical CAFs, 2016, doi: 10.1080/15384101.2016.1253641
(6) Junyun Wang, Xiao Han, Yingli Sun*, DNA methylation signatures in circulating cell-free DNA as biomarkers for the early detection of cancer, Science China Life Sciences, 2016, doi: 10.1007/s11427-016-0253-7
(7) Minjie Zhang#, Chuanchao Wang#, Caiyun Yang#， Hao Meng, Agbagwa, Ikechukwu O., Lingxiang Wang, Yingzhi Wang, Shi Yan，Shancheng Ren, Yinghao Sun, Gang Pei, Xin Liu, Jiang Liu, Li Jin*, Hui Li*, Yingli Sun*，Epigenetic Pattern on the Human Y Chromosome Is Evolutionarily Conserved，PLoS One, 2016, 11(1):e0146402
(8) Minjie Zhang, Caiyun Yang, Huixian Liu, Yingli Sun*, Induced pluripotent stem cells are sensitive to DNA damage, Genomics Proteomics Bioinformatics, 2013, 11(5):320-6

张剑宁

海军总医院

主任医师、教授，博士生导师，享受国务院政府特殊津贴、军队优秀专业技术干部特殊津贴。现任海军总医院神经外科医院院长、全军微创神经外科研究所所长、头部伽玛刀治疗中心主任，海军神经外科专业委员会主任委员、中华医学会神经外科分会全国委员、全军神经外科专业委员会副主任委员、全军神经外科专委会脊柱脊髓专业组副组长、中国抗癌协会脑肿瘤微创与综合治疗专业委员会副主任委员、中国医师协会神经损伤培训委员会副主任委员、中国神经科学学会脑肿瘤学分会常委、中国医师协会脑胶质瘤专业委员会常委、北京医师协会神经外科专科医师分会常务理事、北京医学会神经外科分会常委、世界神经外科联合会（WFNS）会员、国际脑研究组织（IBRO）成员等，是《中华神经外科杂志》、《立体定向及功能性神经外科杂志》、《中华神经外科疾病研究杂志》、《中华小儿外科杂志》、《中华神经医学杂志》、《中华神经外科杂志英文版》、《Neurosurgery中文版》、《解放军医学杂志》等20余种期刊编委。先后获国家科技进步二等奖1项，军队科技进步二等奖1项，军队医疗成果二等奖6项，军队科技进步三等奖2项，陕西省科技进步三等奖1项，陕西省医药卫生科技成果一等奖1项。2014年荣获王忠诚中国神经外科医师学术成就奖。 以第一作者发表学术论文130余篇。对颅脑战创伤救治、脑肿瘤基础与诊治等研究深入，承担全军重大科研课题、国家自然科学基金、863课题及省部级课题10余项，科研经费2300多万元。采用显微外科、神经导航等微创手术治疗脑干肿瘤、颅颈区畸形、海绵窦内肿瘤、颅内动脉瘤、脑动静脉畸形、颅底肿瘤及脊髓内肿瘤等疑难复杂疾病效果良好。成功手术治疗的巨头儿脑积水、头部巨大肿瘤等病例，先后被中央电视台《走近科学》、《健康之路》、《人民的军医》及北京电视台《京城名医》等栏目作了专题报道，社会反响强烈。

何农跃

东南大学生物医学工程学院生物电子学国家重点实验室

何农跃，1997年在南京大学获博士学位(物理化学专业)，2002年4-5月到瑞士苏黎世联邦理工学院（ETH）进行访问研究，2002年9月-2003年9月得到韩国BK21资助到汉城大学进行访问研究。教育部跨世纪人才，全国高校优秀骨干教师。现为东南大学生物电子学国家重点实验室教授，博士生导师，中国生物工程学会生物资源专委会副主任。 近5年来，主要致力于分子诊断新方法及相关仪器的研发工作，建立了多种磁珠制备方法，获得了ISO13485认证；建立了多种基于磁珠（分离）的蛋白、单核苷酸多态性、病原体分子检测技术，并研制出了一系列相关仪器设备如核酸提取仪、多功能杂交仪、高通量生物样本处理系统、卡盒式RT-PCR检测系统等；先后应邀出席8次国际学术交流会，作特邀报告5次；发表SCI论文140余篇，他引5000多次，ESI高他引论文20篇，两篇文章入选2013年中国科学技术信息研究所发布2013年中国学者百篇最具影响力国际学术论文；2015年、2016年入选Elsevier发布的中国高被引学者榜单（“生物医学工程”领域排名第一）；第一发明人和共同获授权发明专利21余项，软件著作权4项，实用新型25多项。获省部级科技进步奖7项（5项（一等奖1项，二等奖4项）排名第一）。

演讲报告题目摘要：

基于磁分离的高通量分子标志物检测与筛查研究

可控合成了功能化磁性纳米颗粒及低荧光背景核壳结构金磁纳米颗粒，以磁性纳米颗粒为基础，建立了多种高通量单核苷酸多态性分型方法并研发了相关器件；建立了基于磁性纳米颗粒和化学发光的高通量拷贝数变异分析方法；建立了基于磁分离与核酸适体的肿瘤标志物筛查方法。首先采用羧基化磁性纳米颗粒为载体，应用SELEX方法筛选特异识别HBsAg的核酸适体，再将磁性纳米颗粒、金纳米颗粒、免疫分析、化学发光检测和核酸适体技术等进行有机结合，建立了新的高灵敏、快速且经济实用的分子标志物筛查与检测方法，为新标志物筛查、疾病的早期、快速检测诊断奠定了基础。

研究方向：

1.功能纳米材料合成、改性及生物医学应用；
2. 高通量分子标志物筛查新方法及器件；
3. 集成式分子检测设备。

学习工作经历：

1981年12月毕业于湖南师范大学化学系；1989年6月毕业于湖南师范大学化学系和湘潭大学化学系物理化学专业（联合培养），获理学硕士学位；1997年在南京大学获理学博士学位(物理化学专业)，随后在东南大学生物医学工程博士后流动站和南京医科大学临床医学博士后流动站从事博士后研究工作。 1981年12月至1986年8月在湖南广播电视大学湘潭分校任助教、讲师；1989年6月至1993年8月在湘潭大学分析测试中心任教师、副教授；1999年2月起在东南大学生物医学工程学院任副教授、教授。自2004年起特聘湖南工业大学绿色化学与生物纳米技术应用湖南省重点实验室主任。

近期发表论文：

1.S. Li, H. Liu, Y. Jia, Y. Deng, L. Zhang, Z. Lu, N. He*, A Novel SNPs Detection Method Based on Gold Magnetic Nanoparticles Array and Single Base Extension, Theranostics, 2012, 2 (10): 967.
2. Z. Wang*, X. Tang, X. Wang, D. Yang, C. Yang, Y. Lou, J. Chen* and N. He*, Near-infrared light-induced dissociation of zeolitic imidazole framework-8 (ZIF-8) with encapsulated CuS nanoparticles and their application as a therapeutic nanoplatform. Chem. Commun., 2016, 52, 12210.
3. Z. Xi, R. Huang, Z. Li, N. He*, T. Wang, E. Su, and Y. Deng*, Selection of HBsAg-Specific DNA Aptamers Based on Carboxylated Magnetic Nanoparticles and Their Application in the Rapid and Simple Detection of Hepatitis B Virus Infection, ACS Appl. Mater. Interfaces. 2015, 7(21), 11215−11223.
4. H. Yang, W. Liang, N. He,* Y. Deng, and Z. Li*, Chemiluminescent Labels Released from Long Spacer Arm-Functionalized Magnetic Nanoparticles: A Novel Strategy for Ultrasensitive and Highly Selective Detection of Pathogen Infections, ACS Appl. Mater. Interfaces. 2015, 7(1), 774−781.
5. M. Liu, P. Hu, G. Zhang, Y. Zeng, H. Yang, J. Fan, L. Jin, H. Liu, Y. Deng, S. Li, X. Zeng*, S. Elingarami, and N. He*, Copy number variation analysis by ligation-dependent PCR based on magnetic nanoparticles and chemiluminescence, Theranostics, 4 (1): 71-85 (2015).
6. L. Zhang, K. Xia, Z. Lu, G. Li, J. Chen, Y. Deng, S. Li, F. Zhou, N. He*, Efficient and facile synthesis of gold nanorods with finely tunable plasmonic peaks from visible to near-IR range, Chem. Mater. 26, 1794-1798 (2014).

张学工

清华大学

清华大学自动化系教授、生命学院兼职教授，清华信息国家实验室生物信息学研究部主任，清华大学学术委员会委员，国家杰出青年基金获得者、国家九七三计划首席科学家、国家级精品课主讲人。兼任清华大学数据科学研究院医疗健康大数据研究中心副主任、清华大学合成与系统生物学研究中心执行主任，中国人工智能学会生物信息学与人工生命专业委员会主任、中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会常务副主任，九三学社北京市委委员、清华大学委员会副主委。

演讲报告题目摘要：

用统计和机器学习进行基因差异表达分析：从基因芯片到RNA测序到单细胞测序

对不同样本之间基因表达差异的分析是进行疾病的分子分型、发现生物标志物和研究疾病发生发展分子机理的重要基础，各种观测检验技术的快速发展，对差异分析不断提出新的方法学挑战。比如，近年来最新发展起来的单细胞RNA测序能够检测单个细胞中的基因表达，对于研究发育和癌症等过程的基因表达时空异质性具有重要意义。由于单细胞中RNA量极低，单细胞测序在RNA捕获和反转录扩增阶段与多细胞测序有很多不同的特点，导致单细胞测序数据具有独特的统计特性，很多传统的RNA测序数据分析方法在处理单细胞数据时遇到大量问题。我们系统地研究了现有方法在单细胞RNA测序数据差异表达分析方面的性能，从中发现了单细胞测序差异表达分析的特殊性，提出了一种区分不同类型单细胞差异表达的新方法，初步实验展示出很大的应用潜力。本报告将回顾作者在基因差异表达和潜在标志物发现方面的系列工作，分享对单细胞RNA测序开展的最新研究，探讨在液体活检、微生物组学等新领域中差异分析和标志物检测的方法学问题。

研究方向：

模式识别与机器学习、健康医疗大数据分析、影像基因组学、RNA测序数据分析、宏基因组测序数据分析等

学习工作经历：

1989年毕业于清华大学自动化系
1994年于清华大学获模式识别与智能系统专业博士学位
1994年起为清华大学自动化系讲师、副教授、教授
2001-2002年为哈佛大学公共卫生学院生物统计系访问学者
2007年为南加州大学分子与计算生物学中心访问学者
2004年起任清华信息科学与技术国家实验室生物信息学研究部主任

近期发表论文：

1.Xuegong Zhang*, Shansong Liu, Hongfei Cui, Ting Chen, Reading the underlying information from massive metagenomic sequencing data, Proceedings of the IEEE, 105(3): 459-473, 2017

2.Zhun Miao, Xuegong Zhang*, Differential expression analyses for single-cell RNA-Seq: old questions on new data, Quantitative Biology, 4(4): 243-260, 2016

3.张学工*，江瑞，汪小我，古槿，陈挺，从生物大数据到知识大发现，《科学通报》，61(36): 3869-3877, 2016

4.Lu Zhang, Xiaoqiao Liu, Xuegong Zhang*, Ronghua Chen*, Identification of important long non-coding RNAs and highly recurrent aberrant alternative splicing events in hepatocellular carcinoma through integrative analysis of multiple RNA-Seq datasets, Molecular Genetics and Genomics, 291(3): 1035-1051, 2016

5.Tatiana C. Mangericao, Zhanhao Peng, Xuegong Zhang*, Computational prediction of CRISPR cassettes in gut metagenome samples from Chinese type-2 diabetic patients and healthy controls, BMC Systems Biology, 10(Suppl 1): 5, 2016

6.Aziz Khan & Xuegong Zhang*, dbSUPER: a database of super-enhancers in mouse and human genome, Nucleic Acids Research, 44(D1): D164-D171, 2016

7.Huijuan Feng, Xuegong Zhang, Chaolin Zhang, mRIN for direct assessment of genome-wide and gene-specific mRNA integrity from large-scale RNA-sequencing data, Nature Communications, 6: 7836, 2015

8.Junfeng Li, Junyi Zhang, Liyang Liu, Yucai Fan, Lianshuo Li, Yunfeng Yang, Zuhong Lu*, Xuegong Zhang*, Annual periodicity in planktonic bacterial and archaeal community composition of eutrophic Lake Taihu, Scientific Reports, 5: 15488, 2015

9.Zhixing Feng, Jing Li, Jing-Ren Zhang*, Xuegong Zhang*, qDNAmod: a statistical model-based tool to reveal intercellular heterogeneity of DNA modification from SMRT sequencing data, Nucleic Acids Research, 42(22): 13488-13499, 2014

王晓良

中国医学科学院药物研究所

研究员，博士导师，1982年北京协和医科大学硕士研究生毕业；1987年在德国埃森大学获医学博士学位，1988年底回国，建立了我国早期的膜片钳（离子通道研究）实验室，并做出突出成绩。1993年获国家首届杰出青年科学基金资助，1995年政府特殊津贴专家，1998年获求实基金会杰出青年学者奖及2004年度卫生部有突出贡献专家。1997-2010任中国医学科学院药物研究所所长。多年来活跃在药学基础研究和新药研发第一线，担任中国药理学会常务理事，生化与分子药理学专业委员会主任委员；中国药学会副理事长，老年药学专业委员会主任；亚洲药学家联盟副理事长等职，2001年以来陆续担任《药学学报》主编；《Naunyn-Schmiedeberg's Archives of Pharmacology》顾问编委及《Journal of Alzheimer's Disease》副主编。
    近年来承担了多项“863”和“973”项目课题，负责承担了“十五”、“十一五”和“十二五”国家药效学平台，研究方向为心脑血管，神经退行性疾病，和以离子通道为靶点的药理学基础研究，及新药评价和开发研究，已建立了一批与国际接轨的药效学评价新方法和新模型，并领导了多个创新药物的研发。所领导的研究团队2005年入选教育部创新团队。自1993年担任博士导师以来，培养了40余位药理学博士。善于启发学生思考，引导学生独立开展研究工作，并注重理论联系实际。目前已发表研究论文约160篇，获授权专利13项（其中国际授权11项），两个项目在全球多个国家和地区获授权，并转让实施，取得较大经济效益。

王秋泉

厦门大学

1998年获日本群马大学工学博士学位。担任Anal. Sci.副主编（2010-2011）、Anal. Bioanal. Chem.国际顾问委员会委员、《环境化学》编委、《科学通报》编委、《分析化学》编委、中国仪器仪表学会原子光谱分析专业委员会副主任委员兼秘书长、中国稀土学会理化检验委员会委员。研究兴趣为色谱与分离科学和原子光谱/质谱分析，主要应用色谱/电泳-光谱/质谱联用技术开展复杂环境和生物体系中关键元素和分子的分析方法学、持久性有毒污染物质的分离和检测，关注相关的“迁移转化”、“生物可利用性/毒性”、“污染环境的生物修复机制”；发展化学选择性和生物专一性元素标记策略，开展金属组学和定量蛋白质组学研究。承担“973”、“863”、国家自然科学基金重点项目等课题的研究工作。在Angew. Chem. Int. Ed., Environ. Sci. & Technol., Metallomics, Anal. Chem., J. Anal. At. Spectrom., J. Chromatogr. A/B, J. Am. Soc. Mass Spectrom.等学术期刊上发表研究论文70余篇，参与Elsevier 编著1部，应邀在国际国内大型学术会议上做大会报告和特邀报告20余次。现任厦门大学化学化工学院化学系分析科学研究所所长。

朱小立

上海大学

2008年获南京大学理学博士，现担任上海大学分子识别与生物传感研究中心副主任、生命科学学院专业主任、上海市细胞生物学学会理事、Int. J. Nanotechnol. Nanomed. Res.等期刊编委等职务，曾获上海市晨光学者、教育部自然科学奖二等奖等荣誉奖项，先后承担国家自然科学基金、上海市自然科学基金等多个科研项目。在Theranostics、Analytical Chemistry等期刊发表60余篇科研论文，其中自然指数期刊4篇，他引800余次，参与编撰专著两部。

演讲报告题目摘要：

循环肿瘤细胞无损分析新方法的研究

研究方向：

分子识别与生物传感

【会议门票】

注册类型	2017年5月05日前到款	2017年5月05日后到款	注册费包含
国内学生	900 RMB/人	1200 RMB/人	会议资料， 午餐， 茶歇
国内学者	1500 RMB/人	1900 RMB/人

备注：三人以上可享受团体优惠票价格，原有基础上再享9折优惠
1、如果您是以学生身份参会，请在现场签到的时候出示您的学生证。
2、请在相应优惠的截止日前完成您的支付，否则系统会将您的优惠转入下一个优惠阶段。
3、注册费不包括: 酒店费用，交通费用。
4、网上报名截止日期：2017年05月16日

取消注册和退款规则：
如果您的行程有变，不能参加我们的会议，可以联系我们取消您的注册。为便于大会组委会筹备工作，最迟可在大会召开前一周取消注册，我们将在会后5个工作日内全款退回您的注册费， 费用将通过银行转账的形式，退回到您的支付账号。感谢您的参与和支持。