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首页 > 培训课程 > 学术/科研培训 > R语言挖掘公共数据库(TCGA、GEO)发表文章 更新时间:2020-11-23T17:02:33

R语言挖掘公共数据库(TCGA、GEO)发表文章
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R语言挖掘公共数据库(TCGA、GEO)发表文章 已截止报名

课程时间: 2020-12-05 09:00至 2020-12-06 18:00结束

课程地点: 线上活动 

会议规模:49人

主办单位: 玮瑜科研平台(上海玮瑜生物科技有限公司)

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        会议通知

        会议内容 主办方介绍


        R语言挖掘公共数据库(TCGA、GEO)发表文章

        R语言挖掘公共数据库(TCGA、GEO)发表文章宣传图

        R语言挖掘公共数据库(TCGA、GEO)发表文章

        现场完成一篇文章的流程以及所有图表,

        全程实战,全程讲解代码,全部是自己的文章

        无限回放,建群完善更好的售后服务

        2020年12月5-6日  (线上授课 互动性强)


        【课程简介】

        没有经费做课题,没有实验造图形?其实,聪明人必须学着绕过去,我们不需要经费,完全不需要实验。

        用R语言挖掘公共数据,发表SCI文章

        R语言是科研工作者必备技能。本次会议以一篇SCI全文复现为目的,不瞎学R,用R解决科学问题,用R去发现新的临床问题。

        【学习目标】

        根据自己的专业,找到课题、挖掘机制、锁定标记物

        基金中呈现漂亮的图表和前期基础

        掌握R语言处理GEO,TCGA数据的所有核心技能

        科研绘图的所有技能

        【课程特色】

        全程实战,全程讲解代码,全部是自己的文章,重点讲解关键步骤,

        更多的售后服务,更好的掌握所有技能。

        最大胆、最全面、最深入人心地直达灵魂地讲解。

        至少2个套路的全程实战,让你快速掌握数据挖掘套路。

        现场完成一篇文章的流程以及所有图表。

        【主办单位】

        玮瑜科研平台(上海玮瑜生物科技有限公司)

        【承办单位】

        上海玮瑜生物科技有限公司

        上海婉怡科技服务中心

        【会议时间】

        2020年12月5-6日   

         

        查看更多

        玮瑜科研平台(上海玮瑜生物科技有限公司) 玮瑜科研平台(上海玮瑜生物科技有限公司)

        玮瑜科研平台(上海玮瑜生物科技有限公司)于2019年12月28日举办2019转录组测序数据分析及案例实践培训班(12月上海班)。

        会议日程 (最终日程以会议现场为准)


        日期

        主题

        主要培训内容

        第一天上午

        8:30-11:30

        R语言实战入门

        R安装

        Rstudio安装

        3小时掌握R语言

        菜鸟如何学习R 语言

        R语言数据构成和流程控制

        如何用好for循环和apply家族函数

        如何转换为可以直接套用代码的数据(数据调整)

        猴哥文章中的数据清洗和整理

        R语言统计和作图简介

        R语言无障碍安装和调用

        R语言导入和导出

        第一天下午

        1:30-4:30

        R语言模块化技能

        GEO数据库从下载、整理、分析、出图、涵义(清除无意义的数据,发表级的热图,最漂亮的火山图,GO分析,KEGG分析,共表达网络)、GEO数据便捷实用的GSEA分析,GEO芯片的探针的注释

        第一天晚上

        7:00-10:00

        全代码实战猴哥芯片meta分析核心部分

        11分的文章实例解析生信联合实验套路

        Sun M. Integrated analysis identifies microRNA-195 as a suppressor of Hippo-YAP pathway in colorectal cancer. Journal of Hematology & Oncology. 2017. 10(1):79 (IF=11.059, PMID: 28356122)

        芯片数据的检索、下载、预处理

        猴哥多个GEO芯片联合分析(芯片meta)简介和制作

        GEO芯片的探针转化为基因名的N种方法

        R语言数据框的调整(掌握tidyr和dplyr)

        GE)芯片的差异分析、GO、KEGG、GSEA等

        学员练习 (线上指导、配给视频练习)

        第二天上午

        8:30-11:30

        全代码复现生存相关signature文章核心部分

        (A prognostic 4-gene expression signature for patients with HER2-negative breast cancer receiving taxane and anthracycline-based

        chemotherapy,Oncotarget, 2017)

        GEO数据下载    TCGA数据下载

        生存相关signature的筛选和降维(lasso模型和rubust模型等)

        批量生存分析

        单因素生存分析

        多因素生存分析

        全代码制图

        全代码制表

        发表级图表的排版

        第二天下午

        1:30-4:30

        TCGA ceRNA文章发表和制作

        Sun M. a comprehensive study based on weighted gene co-expression network analysis and competing endogenous RNA network. Breast Cancer Res Treat. (IF 3.626, PMID: 30715658)

        TCGA数据下载和数据库找课题

        提取mRNA、IncRNA、MiRNA矩阵

        ceRNA网络构建

        批量生存分析、单因素、多因素、制表、制图

        批量GO、KEGG

        实战讲解猴哥例文

        ​​​​​​​

        查看更多

        会议嘉宾 (最终出席嘉宾以会议现场为准)


        【授课老师】

        猴哥:武汉大学博士,副主任医师,讲师,发表SCI论文25篇,历任3家公司数据分析师,100篇meta分析数据分析经验,43场公益讲座授课基础,5年免费答疑的耐心和责任心。主持国家自然科学基金1项,主持省级课题3项、湖北陈孝平科技发展基金会肝胆胰恶性肿瘤研究基金1项、国家级大学生创新创业训练计划项目3项。

        查看更多

        参会指南

        会议门票


        【注册费用】

        3200元/人。

        查看更多

        温馨提示
        酒店与住宿: 为防止极端情况下活动延期或取消,建议“异地客户”与活动家客服确认参会信息后,再安排出行与住宿。
        退款规则: 活动各项资源需提前采购,购票后不支持退款,可以换人参加。

        标签: R语言

        还有若干场即将举行的 R语言大会

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        部分参会单位

        主办方没有公开参会单位
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