生物信息数据处理与Perl语言编程应用专题培训班

2017年06月26日 - 06月28日
北京
¥2600 起

会议介绍

【会议内容】

Perl语言作为绝大多数生物信息学工作者首选语言之一。北京市计算中心生物计算事业部针对没有任何计算机语言的生物学、医学、农学等人员,且有从事生物信息学工作相关研究工作的需要。欢迎您报名参加!


举办地:北京,北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼

培训时间2017年6月26日-28日 (报名中)上午9:30-12:00,下午13:30-17:00


培训特色

1、对口生物信息;   

2、非严格语法,适合初学;

3、功能强大、跨平台;

4、有巨大的第三方代码库CPAN

【会议日程】

培训内容及安排:

日期

授课题目

授课内容

第一天

概述

1.    生物信息学数据处理概述;

2.    Perl语言简介特点与数据处理的优势与应用范围

运行调试

3.    Perl语言解释器、编辑器安装;

4.    Perl运行环境测试与程序编写;

5.    UltraEdit软件应用与生物信息学数据文件处理;

6.    基于宏的perl语言快速编程

操作基础

7.    Perl语言基本变量、操作符、判断结构;循环结构;

8.    Perl语言常用函数的功能应用;

9.    生物学数据文件的读入与输出;

10.  生物信息学常见文件的分割、合并、过滤、信息提取等;

11.  批量自动化数据文件操作

第二天

生物信息实例应用

12.  常用生物信息学数据文件格式简介;

13.  用perl从NCBI、ENA等数据库批量下载基因序列;

14.  用perl进行生物学数据文件格式转化;

15.  用perl编程从Fasta、GBK、Fastq、PDB等提取关键生物学数据信息;

16.  用perl批量自动化下载基因序列;

17.  用perl进行DNA到protein批量翻译;

18.  用perl批量DNA序列反向互补;

高级数据处理

19.  Perl语言的数组、二维数组、hash表用法;

20.  用perl自动化从表格数据提取信息;

21.  矩阵数据文件的生成与应用

22.  二代测序NGS、GWAS等生物信息分析中perl的应用

第三天

模块与子程序

23.  perl子程序与模块应用;

24.  强大的正则表达式的应用;

25.  用perl进行基因ID列表比较、筛选与统计;

Perl的高级应用

26.  Perl第三方代码库CPAN的简介与应用;

27.  Bioperl模块与应用;

28.  常用生物信息学程序实例;

29.  用perl进行批量自动化本地blast比对及数据分析;

30.  基于perl的circos基因组作图工具介绍;

(此表仅供参考,授课内容以实际授课为准)

【会议门票】

注册费:3000元/人(含听课费、资料费、上机费、午餐,请自带笔记本电脑以备上机实践使用),主办方可协助安排入住酒店,住宿费用自理。


报名优惠政策

1、3人以上团体报名每人可减少400元;

2、4+1团报,可免费赠送一个名额                

3、上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。

培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。

拟邀嘉宾

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