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首页 > 培训课程 > 生物/医学培训 > 计算机辅助药物设计技能实操(网络)研讨会12月培训班 更新时间:2022-11-01T15:43:46

计算机辅助药物设计技能实操(网络)研讨会12月培训班
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计算机辅助药物设计技能实操(网络)研讨会12月培训班

课程时间: 2022-12-24 09:00至 2022-12-25 18:00结束

课程地点: 线上活动 

主办单位: 上海循掘生物科技中心

门票名称单价截止时间数量
会务费 暂无说明 ¥3000.0 2022-12-23 17:00

会议介绍

会议内容 主办方介绍


计算机辅助药物设计技能实操(网络)研讨会12月培训班

计算机辅助药物设计技能实操(网络)研讨会12月培训班宣传图

计算机辅助药物设计技能实操(网络)研讨会

20221224-25 腾讯网络会议

背景简介:

近年来,随着计算机科学及相关基础学科的发展与进步,基于计算机图形学、数据库技术、人工智能等新技术的药物分子设计手段正日臻成熟,不断取得突破性进展,有力推动药物设计领域日趋完善。这不仅为新药创制事业提供了新利器,更有效加速了新药成功开发的概率、缩短新药上市周期,更好地满足临床需求。

计算机辅助药物设计computer-aided drug designCADD通过计算机模拟等计算方法,预测药物与受体生物大分子之间的关系,设计和优化先导化合物。这种方法大大加快了新药设计的速度,节省了药物发现的人力和物力,使药物学家能够以理论为指导,有目的地开发新药。同时,在药物机制的研究中,在用实验方法验证药物与受体的相互作用之前,通常会用分子对接的方法预测药物与靶标的结合,以节省实验花费。计算机辅助药物设计已经成为新药开发、药物机制研究中重要的研究手段之一。


学习目标:

本课程系统讲解计算机辅助药物设计的关键技术,配合案例解析边讲边练,使学员能运用模拟软件针对每个技术点进行上机操作。学习班全部采用免费数据库、免费软件、和在线分析工具,学员不需要编写程序。适合零基础学员,做到课程学完,就能独立进行蛋白质结构同源建模、分子对接、虚拟筛选等计算分析


授课方式:

本学习班全程在线电脑实战教学,90%以上为上机指导操作,无繁琐的理论授课。建立专属班级交流平台,学员学完后可以继续在班级群与老师同学交流问题,巩固学习内容。


参会对象

各级医院临床医生、药师、科研单位研究人员、高校老师、硕/博士研究生、对计算机辅助药物设计感兴趣的广大师生(尤其适合初学者和无基础的学员,无需任何基础,也无需学习任何编程语言


讲师简介:主讲老师是生物信息学博士,大学教授, 从事计算生物、生物信息学方向研究十年,主持参与了多项国家自然基金项目,发表数十篇SCI论文,含多篇5分以上的文章。讲课效果好,深得学员好评。


主办方:上海循掘生物科技中心

会议时间20221224-25

每天9:00-17:00

会议地点线上:腾讯网络会议室,



 

详细日程参见日程表



时间

授课内容

第1天

8:30-12:00

1. 分子对接基础知识

2. 分子结构文件的获取和处理

  1. 化合物结构的获取
  2. 化合物ADMET性质预测
  3. 多肽结构的获取
  4. 蛋白结构的获取
  5. 蛋白结构的同源建模
  6. 不同格式结构文件的转换

3. PyMol软件介绍

  1. 蛋白对象的操作、展现、隐藏、标记、测量
  2. 分子对接结果的美化展示

13:30-17:00

1. 配体-受体结合位点可视化分析工具介绍

2. 用AutoDock及autoDock vina进行小分子与蛋白对接

  1. 准备工作
  2. 准备受体文件
  3. 准备配体文件
  4. 确定对接盒子
  5. 蛋白受体格点计算
  6. 设置对接参数
  7. 用AutoDock作分子对接
  8. 结果查看与分析
  9. 用AutoDock vina 作对接
  10. 确定对接盒子的其他方法

第2天

8:30-12:00

  1. 用AutoDock Vina 作虚拟筛选
  1. 蛋白活性口袋的预测
  2. 化合物的下载与处理
  3. AutoDock vina 进行一对多或多对多的对接
  4. 计算redocking多个pose的RMSD
  5. 虚拟筛选


  1. 金属酶蛋白与小分子对接
  1. 用AutoDock4Zn作对接的方法
  2. 用AotoDock vina作对接的方法
  1. 蛋白-小分子柔性对接

13:30-17:00

  1. 蛋白-多肽对接
  1. 用免费在线平台作对接
  2. 用ADCP作对接—结合位点已知的情况
  3. 用ADCP作对接—结合位点未知的情况
  1. 蛋白-蛋白对接
  1. 用免费在线平台作对接
  2. 蛋白-蛋白相互作用界面的展示

备注:自带笔记本电脑,安装WINDOWS 64位操作系统。








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上海循掘生物科技中心

上海循掘生物科技中心于2020年2月21日举办TCGA&GEO生信高通量数据挖掘分析研讨会2020(2月深圳班)会议。

会议日程


即将更新,敬请期待

会议嘉宾


即将更新,敬请期待

参会指南

会议门票


会务费用3000/

优惠政策:

1.提前确认报名及转账的,可以提前拿到学习材料

2.三人组团报名,每人优惠100

3.四人组团报名,每人优惠200元,

4.人组团报名缴费,可免1人参会费

可以开正规会务发票,纸质邀请函(盖红章)。

注意事项:必须使用64windows系统,苹果电脑请做好双系统

另外需安装腾讯会议软件。

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温馨提示
酒店与住宿: 为防止极端情况下活动延期或取消,建议“异地客户”与活动家客服确认参会信息后,再安排出行与住宿。
退款规则: 活动各项资源需提前采购,购票后不支持退款,可以换人参加。

还有若干场即将举行的 药品大会

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会议地点

部分参会单位

主办方没有公开参会单位
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