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首页 > 培训课程 > 学术/科研培训 > Python生物信息从入门到进阶研讨会12月培训班 更新时间:2022-11-01T15:38:54

Python生物信息从入门到进阶研讨会12月培训班
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Python生物信息从入门到进阶研讨会12月培训班 已截止报名

课程时间: 2022-12-02 09:00至 2022-12-04 18:00结束

课程地点: 线上活动 

主办单位: 上海循掘生物科技中心

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        会议介绍

        会议内容 主办方介绍


        Python生物信息从入门到进阶研讨会12月培训班

        Python生物信息从入门到进阶研讨会12月培训班宣传图

        Python生物信息从入门到进阶研讨会

        2022年12月2-4日 腾讯会议网络会议室

        课程背景】Python是一种结合解释性、编译性、互动性和面向对象的脚本语言。它设计简洁,具有很强的可读性。Python目前拥有众多专用的科学计算扩展库,以及生物信息学专用的Biopython,为分析处理生物信息学数据提供了强大功能。越来越多的科研人员开始学习Python语言用于机器深度学习,来处理实验数据、制作图表。


        【课程特色】
        1. 本课程覆盖python基础知识,通过atom程序编辑软件进行python程序写作。

        1. Deep learning,决策树,支持向量机,神经网络

        3. Github程序库介绍,Git使用下载、上传、协作软件编辑,

        4. Python基本软件包Numpy、Pandas、Matplotlib、SKlearn及磁共振软件包nibabel介绍
        5. 本课程手把手,实操性强,有全程屏幕录制视频课后发给学员,组群学员微信群便于学员与讲师互动交流


        【讲师背景】
        专家,博士生导师。研究方向生物物理、生物光子学、生物医学虚拟场景开发。05获中科院分子发育生物学硕士学位,08年获美国东北大学物理化学硕士学位,13年获美国密苏里大学哥伦比亚生物物理博士学位与统计硕士学位,13-18年在加州大学伯克利分校博士后。目前已在Cell,Nature Communications,EMBO reports,ACS Sensors等杂志发表文章十余篇。

        【主要内容】详细内容见课表

        Git软件使用、Python编程详解


        【学习目标】
        通过学习,让学员掌握:Git、Atom的基本使用、python数据结构;python的输入输出、方程、模块、循环、算法、寻找bug;python常见软件包numpy、pandas、matplotlib、SKlearn、nibabel等安装使用及软件包功能介绍;通过python进行小的数据、图像、数学、统计计算分析;python深度学习介绍,人工智能训练线性及卷积神经网络。


         

        以下为详细日程:

        Python学习班课程安排

        日期

        时间

        主要内容

        详细内容

        备课

        19:00-20:30

        软件安装

        GitAtomPython安装


        第一天上午

        9:00-10:30

        计算机语言基本介绍

        计算机语言介绍、不同语言比较、Python的优缺点、Github介绍

        程序的组织与写作、Git介绍

        基本数学计算、变量、字符、文字

        交互式输入与输出、上载与下载文件

        10:30-10:45



        10:45-12:00

        计算机语言数据结构与逻辑教学

        交互式输入与输出、上载与下载文件

        循环与逻辑

        数据结构:序列和字典


        12:00-13:00

        午休时间

        第一天下午

        13:00-15:30

        编程基本讲解与Python软件包教学

        面向对象编程

        模块、类与对象

        Python软件包,如何制作并使用

        Debugging、自测试

        15:30-15:45



        15:45-18:00

        基本程序写作及网络数据挖掘写作

        Python统计计算,均值、方差、t统计、p值、pdfcdf统计分布图

        基本网络数据挖掘写作


        第二天上午

        9:00-10:30

        Matplotlin软件包及实操(一)

        Matplotlin软件包介绍

        现状图、柱形图、散点图、

        轮廓图、图像保存

        一般图像的输入、输出

        10:30-10:45

        休息

        10:45-12:00

        Matplotlin软件包及实操(二)

        矩阵基础、数字图像是什么?

        基本图像数字处理、平移、缩放、旋转

        Affine转化、图像切割、多图绘制


        12:00-13:00

        午休时间

        第二天下午及晚上

        13:00-15:30

        Numpy软件包介绍及实操(一)

        Numpy软件包介绍、数组属性

        创建数组、数值性质、切片索引

        高级索引

        15:30-15:45

        休息

        15:45-18:00

        Numpy软件包介绍及实操(二)

        广播、数组迭代

        数组操作、位运算、字符串函数

        数学函数、统计函数、基础统计介绍

        矩阵库、线性代数运算

        18:00-19:00

        晚饭及休息时间

        19:00-22:00

        mxnet软件包介绍及实操

        线性神经网络、softmax回归

        图像分类MNIST

        多层感知机

        深度学习计算,卷积神经网络


        第三天上午

        9:00-10:30

        Pandas软件包介绍及实操

        Pandas软件包介绍

        选择数据、设置值处理、数据丢失、合并出图

        全基因组sgRNA数据的分析、sgRNA序列提取、GC含量、sgRNA位置信息提取、sgRNA序列比对

        10:30-10:45

        休息

        10:45-12:00

        Biophython软件包介绍及实操

        基因序列管理、比对

        DNA序列转录、翻译

        多序列比对、序列输入输出

        Nibabel软件包及实操

        Nibabel软件包介绍

        磁共振MRI数据读取

        矩阵提取、结果可视化、运动矫正、线性回归

        磁共振MRI数据读取


        12:00-13:00

        午休时间

        第三天下午

        13:00-15:00

        Scikit learn软件包及实操

        矩阵提取、结果可视化、运动矫正、线性回归

        线性回归

        分类、无监督

        数据降维、数据预处理、PCAK-means、支持向量机SVM、决策树

        15:00-15:15



        15:15-17:00

        Tensorflow深度学习介绍

        卷积、正向反向传播、优化器、损失函数、池化、BN

        LeNet, AlexNet, VGGnet, Inception, ResNet网络介绍与应用

        图网络与超图网络介绍

        备注:务必自带电脑,要求windows系统,有大于50G可用内存。学习班可提供安装包






        医药加金牌学习班特色:

        医药加金牌学习班自2017年1月正式开办以来,已经成功举办了千余期,培训了全国(包涵港、澳、台地区)及加拿大、丹麦、澳大利亚等国家超过千家科研单位的近万名学员。良好的课堂氛围和讲师耐心的课后跟进,获得了学员的交口称赞。医药加金牌学习班,是让学员们真正能够学以致用,在科研上更上一层楼的学习班。


        学习班教学宗旨:教得多,讲得精,学得会,用得上。

        讲师团队:医药加金牌学习班所有讲师都来自于科研一线,博士以上学历,高级职称,具有丰富的实战经验和讲课经验,保障了学习班的内容的实用性、趣味性。

        课程内容:课程内容为讲师亲自设计,以科研工作者切身需求为出发点,将课程方向与当前热点完美结合。全程纯干货、无套路。

        课堂效果:小班制教学,讲师面对面授课,互动性强,答疑时间充足,有问题现场解决。上课PPT完全拷给学员。

        课后保障:组建长期微信群,讲师与学员可长期互动。也方便学员之间联系,进行横向合作。了解最新课程安排。

        实际效果:很多上过学习班学员,已经反馈成功发表文章,基金中标。

        查看更多

        上海循掘生物科技中心

        上海循掘生物科技中心于2020年2月21日举办TCGA&GEO生信高通量数据挖掘分析研讨会2020(2月深圳班)会议。

        会议日程


        即将更新,敬请期待

        会议嘉宾


        即将更新,敬请期待

        参会指南

        会议门票


        培训时间2022年12月2-4日1日晚上有预备课

        培训地点: 腾讯会议

        地点腾讯会议网络会议室

        主办方:上海循掘生物科技中心

        收费标准:

        3800元/人, 注册费包含教材、但不包括住宿费和晚餐。

        优惠措施提前报名并付费可以提前拿到学习资料

        3人组团,每人优惠100元,4人组团,每人优惠200元

        6人组团,可免一人注册费(即只交5个人的费用)

        参加复听的学员,每人只需交600元费用(可以这次一起向单位多申请600元)

        查看更多

        温馨提示
        酒店与住宿: 为防止极端情况下活动延期或取消,建议“异地客户”与活动家客服确认参会信息后,再安排出行与住宿。
        退款规则: 活动各项资源需提前采购,购票后不支持退款,可以换人参加。

        标签: Python

        还有若干场即将举行的 Python大会

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        部分参会单位

        主办方没有公开参会单位
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