会议介绍
学习班简介
众所周知,R软件是用来做统计分析和作图的软件,医药加开设R语言学习班之后,
受到广大学员的热烈欢迎,课程的设计合理,实操性强,还有助教在课堂现场做辅助,让大家能及时充分获得R语言的指导, 还会建立学员微信群,便于课后学员随时向讲师请教咨询。
本次学习通过手把手教学让学员掌握R软件下载安装、Rstudio用法、常用医学统计学算法模型R实现、R语言常用作图、R语言数据处理方法与编程技术、掌握R语言自主学习实践的方法与技巧,现场解答学员在实际工作中遇到的有关技术问题,让学员更好地掌握相关技术的应用。另外,课后学员有感兴趣的图片,老师也可以提供相应的R代码。
总体思路是根据生信相关的SCI文章为主题,完成里面所有的分析内容。该培训适用于对生信分析或者医学统计学分析感兴趣,编程零基础及以上的学员参加。
培训目的与培训预期
培训预期:通过2天的培训(半天理论课程+1天半实践操作),可以学会R语言基础(输入文件格式、输出文件格式、操作代码的参数调整)、统计学上各种算法的实现、SCI常用图片生成2天培训合格后,颁发专业技术人员继续教育培训证书。
学习班组织方
主办方:医药加学习班
承办方:上海遐永生物科技有限公司
【会议日程】课程具体安排
课程 | 主 要 内容 | |
第 一 天 | R语言——编程环境、数据结构、语法和练习 | R软件的历史、简介、优缺点 |
R编程形式与资源 | ||
R软件的安装 | ||
Rstudio使用技巧及安装 | ||
R语言的数据结构 | ||
R语言的编程方法 | ||
一起练——R语言的编程练习 | ||
生信参考文献解读 | 生信文献的流程解读 | |
常用的生信分析流程 | ||
流程模块使用的R包及函数简介 | ||
案例展示 | ||
常用R函数 | 统计编程思想与流程 | |
数据描述性分析R实现 | ||
假设检验R实现 | ||
方差分析R实现 | ||
回归分析R实现 | ||
共表达分析R实现 | ||
其他常用函数 | ||
实战操作演练——卡方检验、回归分析、方差分析、Fisher精确检验、相关性分析等 | ||
第 二 天 | 常用R 包 | R包的安装 |
芯片数据预处理——affy包 | ||
差异分析——limma包、samr包 | ||
Venn图构建——venndiagram包 | ||
Heatmap图构建—— ggplot2包 | ||
GO,pathway富集分析——clusterProflier包 | ||
生存曲线分析——survival包 | ||
实战分析操作演练——数据预处理、差异分析、主成分分析、功能富集分析 实战图片绘制——箱式图、散点图、热图、venn图、生存曲线KM图、气泡图等 | ||
R语言学习的方法与技巧 | 算法思想、R包及函数用法、参数说明、范例程序 | |
如何找到有用的R资源 | ||
R语言学习小窍门 | ||
互动环节与答疑 | ||
讲师简介
宋博士
成果:参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建;完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。
研究方向:有近十年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perl、R等编程语言。
培训经历:在上海、沈阳、济南、武汉等城市举办过十几场培训班。培训的对象有:医生、学生、科研工作者、生信爱好者等。
培训方向:《测序与芯片数据分析》、《生物信息学的魅力》、《生信文章实例解读》、《生信与实验的密切关系》、《生信与临床医学的关系》、《生信实用工具培训》、《多组学整合分析流程》、《R语言培训》等
【会议门票】学习费2800元每位(学习费包含电子版教材、午餐,住宿费自理,保证学员完全掌握。)
可以开正规会务发票,纸质邀请函(盖红章)。
注意事项:携带windows系统的电脑,苹果电脑请务必提前做好双系统。现场不得录音录像。

