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首页 > 培训课程 > 生物/医学培训 > 用R语言进行科研数据挖掘实战会议(1月) 更新时间:2020-12-11T16:45:16

用R语言进行科研数据挖掘实战会议(1月)
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用R语言进行科研数据挖掘实战会议(1月) 已截止报名

课程时间: 2021-01-16 08:30至 2021-01-17 17:00结束

课程地点: 线上活动 

会议规模:50人

主办单位: 上海莫速乎教育投资有限公司

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        会议通知

        会议内容 主办方介绍


        用R语言进行科研数据挖掘实战会议(1月)

        用R语言进行科研数据挖掘实战会议(1月)宣传图

        R语言进行科研数据挖掘实战会议

        无实验无数据没关系,挖掘别人的数据,发表自己的文章

        两天一夜高强度实训,讲究实战,所有经验和盘托出

        会后赠讲课录像便于反复复习保障效果(加密播放不零售,保障学员优势权利)

        第二十五期 2021/1/16-17  网络精讲班(会议时间两天&一晚)

         

        还在认为没有实验就不能发表论文?还在为不精通挖掘GEO,TCGA,SEER的数据库而痛苦不堪?还在为不知道如何找课题找靶点而苦恼?还在为不会那些高大上的图表而暗自伤神?快来参加莫速乎的科研数据挖掘实战专题学习班吧,挖掘别人的数据,发表自己的文章,一次学习,不再报班!

        本会议由于带着明确的目的性去学习R语言,且针对有/无R语言基础的学员均具有很大宽容性,自开班起就广受好评。随着近年来生物信息学技术的普及,R语言是每个科研工作者都有必要掌握的技能,以往漫无目的的学习R效果不理想,用R去进行科研数据挖掘,既学习了R又解决了实际科研问题。


        学完课程并掌握后能干什么:

        1.没有课题的时候找到课题,没有机制的时候挖掘机制

        2.为基金申请保驾护航,发表paper如虎添翼

        3.掌握R语言的核心技能,GEO,TCGA,SEER的数据处理没有压力

        4.科研绘图:以一敌百,高端大气,私人订制。


        这是一份带有诚意且注重实战的数据挖掘课程。我们的目标是:一次学习,不再报班。


        课程特点:

        1.不留秘密,私货全出,全程只用R语言,关键步骤不隐藏。

        2.第一天晚上时间充分利用,增加带有讲师指导的练习,更多的训练时间,更好的掌握。

        3.讲最核心的知识,讲通用的技能,学后可应用到其他数据库的挖掘。

        4.实例操作(至少3个套路),让你快速掌握数据挖掘套路。

        5.现场完成一篇paper的思路以及图表。


        适合人群:

        广大临床/科研工作者及心有热血被困囚笼的研究生

        时间地点:

        第二十五期 2021/1/16-17  网络精讲班(会议时间两天&一晚)

        注册费用:

        3400元/人  注册费包含网络直播平台费、专家讲课费及视频课程的费用。

        主办单位:莫速乎教育(上海莫速乎教育投资有限公司)、上海荆麦信息科技中心


        参会要求:

        1、请自备笔记本电脑WINDOWS系统或mac系统均可。

        2、所用软件会前三天微信发软件及安装教程,请自行下载安装。

        3、会议期间寄送经盖章的纸质邀请函、发票供报销使用。


        查看更多

        上海莫速乎教育投资有限公司 上海莫速乎教育投资有限公司

        莫速乎科研教育,简称莫速乎,原名“多圈课堂”,创立于2012年12月,隶属于上海莫速乎教育投资有限公司。2014年3月更名为“莫速乎科研教育”,品牌名源于我国古代著名教育家《荀子·劝学》“学之经 莫速乎”。莫速乎旨在通过独创的EAT理念打造最易接收并最能提高实际技能的高清视频课程,以作为科研传统教育的补充或替代。同时将持续开展现场研讨班,以弥补视频课程之不足。EAT理念以荀子思想为根基,并从“学”的角度优化教学,且课程策划符合哲学的认识论规律,是目前“最符合人性”的教学理念。在课程策划方面,我们坚信每个小领域只需要一部课程,一部优秀的课程,经典的课程,足可供全国千百万人学习,莫速乎正是立志于打造每个小领域内的这一部课程。

        会议日程 (最终日程以会议现场为准)


        日期

        时间

        内容安排


        第一天

        08:30-11:55

        R语言基础知识介绍
        R语言数据结构以及循环控制(向量,因子,矩阵,数据框,列表,for循环,if控制)
        编写自己的第一个批量处理数据的程序

        R语言中数据框的操作(增删改查)
        真实数据的清洗和整理
        R包以及bioconductor资源的使用
        R包无敌安装攻略
        R语言绘图系统

        R语言读入以及写出数据








        11:55-13:30

        休息


        13:30-17:00

        使用卡片复习R语言基础姿势(两天中重复4次)

        GEO数据库成套流程实战(数据清洗,热图,火山图,GO分析,KEGG分析,共表达分析)

        GEO数据便捷实用的GSEA分析

        GEO芯片的探针probe转化方法汇总

        多个Geo芯片联合分析







         

        17:00-18:00

        休息


        晚上

        18:00-21:00

        R语言数据框的操作练习(掌握tidyr和dplyr)
        如何根据需求绘制一个漂亮的火山图(学习ggplot2)
        使用R语言制作特定肿瘤所有基因表达的数据库

        TCGA原始数据的下载(GDC方法和R包方法)

        任意癌症任意基因在癌和癌旁的表达

        如果有亚型,在不同亚型中的表达

        如果有肿瘤有分期,在不同临床分期中的表达

        单个基因在多个正常组织中的表达

        单个基因在多个细胞系中的表达

        单个基因在多个肿瘤中的表达

        两个基因的相关性如何分析




        第二天

        08:30-11:55

        差异分析(从counts数据开始整理表达数据,表达矩阵归一化,DESeq2)
        提取mRNA矩阵

        提取IncRNA矩阵

        提取MiRNA矩阵

        CeRNA网络构建

        单基因的GSEA分析

        神技能:注释任何一个基因包括长链非编码RNA


        使用多种统计算法定位 signatures cox,lasso回归


        生存分析
        绘图美化
        任意癌症中任意基因的生存分析
        任意癌症中批量生存分析


        TCGA文章的框架分析以及复现


        答疑环节


        11:55-13:30

        休息


        13:30-17:00

        利用GEO和TCGA数据库找到课题
        利用GEO和TCGA数据库发掘下游机制

        如何利用GEO和TCGA数据库申请基金
        如何利用GEO和TCGA数据库发表文章
        现场完成一篇生信文章的所有图表
        提出科研假设
        根据科研假设下载整理数据导入R语言                              

        在R语言中清洗和整理数据达到对应R包的要求

        数据处理过程中调整分析策略
        绘制各个部分需要的图表






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        会议嘉宾 (最终出席嘉宾以会议现场为准)


        主讲人简介:

        果子老师,在生信方面具有丰富经验,本次进行两天一晚的高强度实操训练,目标是让大家一次学习不再报班。讲师已在生信网站及公众号发布上万条生信相关帖子。作为临床科研工作者,深知无课题之苦,因此愿将所学知识和盘托出,没有隐藏。致力于给非生信专业人员普及生物信息学,擅长各种组学的处理,且讲课诙谐幽默。


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        参会指南

        会议门票


        票种名称 价格 原价 票价说明
        普通票 ¥3400 ¥3400 注册费包含网络直播平台费、专家讲课费及视频课程的费用

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        温馨提示
        酒店与住宿: 为防止极端情况下活动延期或取消,建议“异地客户”与活动家客服确认参会信息后,再安排出行与住宿。
        退款规则: 活动各项资源需提前采购,购票后不支持退款,可以换人参加。

        标签: R语言

        还有若干场即将举行的 R语言大会

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        会议地点

        部分参会单位

        主办方没有公开参会单位
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