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首页 > 商务会议 > 医疗医学会议 > 2019单细胞测序数据分析与研究思路研讨会(12月上海班) 更新时间:2019-11-07T09:53:53

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2019单细胞测序数据分析与研究思路研讨会(12月上海班)
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2019单细胞测序数据分析与研究思路研讨会(12月上海班) 已截止报名

会议时间: 2019-12-21 08:00至 2019-12-22 18:00结束

会议地点: 上海  上海浦东中兴和泰酒店  浦东新区科苑路866号 周边酒店预订

主办单位: 上海遐永医药科技

发票类型:增值税普通发票 增值税专用发票

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        会议介绍

        会议内容 主办方介绍


        2019单细胞测序数据分析与研究思路研讨会(12月上海班)

        2019单细胞测序数据分析与研究思路研讨会(12月上海班)宣传图

        【会议背景】

        单细胞测序是从单个细胞水平对基因组和转录组进行研究。2015年以来,10X Genomics、Drop-seq、Micro-well、Split-seq等技术的出现,彻底降低了单细胞测序的成本门槛。自此,单细胞测序技术被广泛应用于基础科研和临床研究。通过单细胞测序可以最大程度的反映细胞的异质性,发现新的细胞群和细胞亚群,并为阐明细胞状态转换的调控机理提供了技术保障。单细胞技术以及数据分析方法在肿瘤、发育生物学、免疫学、神经科学等领域有重要应用,是现今生命科学研究的焦点。


        【会议特色】

        本次课程以近期CNS文章为案例主线,逐一详细剖析,全程电脑实战教学。理论与实践相结合,老师将以最简单易懂的方式,既介绍单细胞测序的研究方法、分析内容和最新前沿进展,又介绍具体的数据库、工具和软件的使用,并在课堂上进行上机指导。讲师经验丰富,教学深入浅出,能让大家获得从单细胞组学原始数据实现CNS图形绘制的实战能力。


        【主要内容】

        详细内容见课表

        1.熟悉单细胞组学图表解读和研究思路。

        2.掌握单细胞组学分析标准流程和常用软件。

        3.熟悉单细胞数据的分型和marker基因鉴定。

        4.掌握单细胞数据的轨迹分析及功能富集分析。

        5.了解单细胞课题设计方法及研究思路。


        【预期目标】
        本学习班由多年从事单细胞组学研究的科研人员授课,通过深入浅出的理论讲解和实例案例,帮助学员拓展研究思路,提升科研水平,增加职业竞争力。通过本次课程培训将使学员系统掌握当前主流的单细胞组学分析流程、方法和软件,从零基础实现到CNS图表的绘制,同时提升研究深度和广度,拓宽研究思路。


        【使用软件】

        主要使用R和Rstudio,部分涉及Lniux

        会议时间:2019年12月21-22日,20日可报到(下午3点-晚上8点)

        会议地点:上海市浦东新区科苑路866号 中兴和泰酒店 

        主办方:上海循掘生物科技中心

        查看更多

        上海遐永医药科技

        南京巴傲得生物科技有限公司(Biogottechnology,co,Ltd),是专一服务于生命科学研究的专业技术型企业。是一大批志同道合的资深专业人士共同创办的具有现代化经营管理水平的生物高科技企业,从事生物技术产品的开发及销售,致力于将巴傲得生物打造成中国乃至世界一流的生物技术产品供应商。巴傲得生物长期备有Bioworld抗体现货4000多种抗体可以在一周左右送到客户的手里。精湛品质、合理价格、专业服务,是我们为您服务的宗旨。在细胞信号通路、免疫学、蛋白组学上拥有显著优势,其抗体产品、生长因子等为生命科学科研工作者提供了极大的便利。

        会议日程

        (最终日程以会议现场为准)


        细胞测序数据分析及研究思路研讨会议程

        第一天上午(理论)

        9:00-10:30

        单细胞测序技术与应用

        1. 单细胞组学技术发展历程和原理介绍。

        2. 单细胞测序技术在科研领域的应用。

        3. 近年单细胞技术CNS文章思路解析。

        10:30-10:45

        茶歇

        10:45-12:00

        单细胞测序图标解读及思路

        4. 单细胞文章常见图表解读。

        5. 单细胞组学技术在癌症、发育、免疫及在植物等领域的研究内容及思路。

         

        12:00-13:30

        午餐及午休

        第一天下午(实操)

        13:30-15:30

        Linux及R语言入门、软件安装

        1. 常规基础Linux命令入门讲解及实操训练。

        2. R语言简介及安装,RStudio的安装及使用说明。

        3. R语言语法介绍及常用命令。

        15:30-15:45

         

         

        15:45-17:00

        R语言数据处理实操

        4. 数据处理功能及统计应用。

        5. R语言画图实操:tSNE,小提琴图,热图,网络图,GO、KEGG富集图,GSEA等图形绘制。

         

        17:00-18:00

        晚餐及休息

        第一天晚上(理论)

        18:00-21:00

        单细胞转录组数据分析思路及流程

        1. 单细胞高分文章分析思路解析(细胞类群确定、拟时间分析、差异表达、通路富集、转录因子、配体受体互作等)。

        2. 单细胞转录组比对、定量、分群及拟时间分析等软件及参数。

        3. 单细胞转录组转录因子、功能通路及配体受体互作思路解析。

        4. 单细胞组学分析常用数据库介绍及使用。

        5. 基因富集分析和可视化。

        第二天上午(实操)

        8:45-10:30

        单细胞数据可视化、细胞分型

        1. 10X官方单细胞软件Cellranger讲解及实操。

        2. 从基因表达矩阵开始到marker基因筛选全过程讲解及实操。

        3. 通过Seurat软件进行PCA及tSNE降维。

        10:30-10:45

        茶歇

        10:45-12:00

        单细胞数据marker鉴定及差异分析

        4. 单细胞转录组细胞鉴定及聚类分析。

        5. 通过Seurat及GSVA等进行单细胞转录组差异分析。

         

        12:00-13:30

        午餐及午休

        第二天下午(理论+实操)

        13:30-15:00

        单细胞数据轨迹分析,功能富集

        1. 通过Monocle软件进行单细胞转录组拟时间分析。

        2. 通过DAVID及metascape网站进行通路富集分析。

        3. 单细胞数据分析总结。

        15:00-15:15

        茶歇

        15:15-17:00

        单细胞数据挖掘思路及标书构思、准备

        1. 归纳总结零成本单细胞数据挖掘思路。

        2. 单细胞测序基金申请思路、准备内容及注意事项等。

        备注:必须携带电脑,上课主要软件为R和Rstudio,涉及部分Linux系统,讲师会详细带着操作

         

        查看更多

        会议嘉宾

        (最终出席嘉宾以会议现场为准)


        【讲师背景】
        来自中科院,长期从事单细胞多组学方面的项目研究,目前已在Nature等杂志发表文章四十多篇,承担国家科技部、国家自然基金委和重点研发计划等多项课题。

        查看更多

        参会指南

        会议门票 场馆介绍


        收费标准:会务费:3300元每位(包含电子版教材、午餐,住宿费自理。)

        优惠政策:

        1. 提前确认报名及转账的,可以提前拿到学习材料

        2. 三人组团报名,每人优惠100元

        3. 四人组团报名,每人优惠200元,

        4. 五人组团报名缴费,额外带一人免费注册! 

        可以开正规会务发票,纸质邀请函(盖红章)。 

        注意事项:携带windows系统的电脑,安装最新版本R和Rstudio

        查看更多

        上海浦东中兴和泰酒店 上海浦东中兴和泰酒店

        交通指南:

        浦东张江地区驾车距离2.7公里(约6分钟)、上海浦东国际机场驾车距离26.2公里(约42分钟)、上海虹桥国际机场驾车距离30.5公里(约74分钟)

        上海中兴和泰酒店位于浦东张江高科技园区的核心地带,附近有地铁二号线张江高科站,毗邻新国际博览中心、磁悬浮车站,距离迪士尼度假区20分钟车程左右;周边生活设施齐全,有集餐饮、KTV、电影院等休闲娱乐为一体的综合性休闲广场。

          

          酒店占地面积一万多平方米,属园林景观式酒店,拥有精心装修的各式客房,环境优雅、舒适,特设园林景观房、湖景套房。同时酒店全面覆盖WIFI,让你随时随地享受网上冲浪的乐趣。

          

          店内有中、西餐厅、商务中心、大堂吧、10个中小型会议室、健身房、乒乓球室和SPA馆,装修温馨舒适、服务贴心细致,让你流连忘返。


        温馨提示
        酒店与住宿: 为防止极端情况下活动延期或取消,建议“异地客户”与活动家客服确认参会信息后,再安排出行与住宿。
        退款规则: 活动各项资源需提前采购,购票后不支持退款,可以换人参加。

        还有若干场即将举行的 细胞测序大会

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