SIESTA材料模拟基础班（10月北京班）

siesta 课程主题

siesta 课程内容

一、密度泛函理论(DFT)及相关软
件介绍

1.DFT 密度泛函理论基本原理方法
2.Hohenberg-Kohn 定理
3.Kohn-Sham 方程
4.DFT理论在材料模拟中的应用

二、 Linux， MS 基础以及 Linux
系统软件安装

1. Linux 基本操作：

  文件复制，移动，重命名，比较， 任务提交，删除
2．Material Studio 结构模型创建
3．常见软件在 Linux下的编译和安装

4. 常见任务管理系统介绍，以及队列系统中任务的提交管理

三、 siesta 基本原理及其赝势
和基组

1．siesta 程序介绍，安装及简单例子运行测试
2. siesta 赝势设置
3. siesta 基组设置
4. siesta 输入文件 fdf 设置
5. siesta 实际例子（Si 晶体和 H2O 分子）计算

四、 siesta 常见计算参数设置

1.结构优化、能量和性质计算流程；
输入和输出文件内容的讲解；
关键词的使用方法；
断点重启、计算结构可视化。
2.泛函的选择、自旋极化设置、 K-points 设置、 布里渊区路径设置、
并行运行方法、基组的选择、轨道截断半径设置等
3.重要参数的原理、设置技巧、使用注意事项；
常见问题的处理方法；
关键字的设置和应用方法；
高精度计算的案例操作。

五、 高级建模以及 siesta应用实例

1. 纳米量子点结构模拟分析 （Si 纳米团簇， 单分子计算）
2. 一维纳米条带,纳米线结构搭建；缺陷、掺杂体系分析等
（armchair 和 zigzag 纳米管以及 stone-wall 缺陷）

3. 二维纳米平面结构，石墨烯计算   
4. 材料晶格动力学分析计算 （Si 动力学稳定）
5. 基于第一性原理分子动力学计算判断材料稳定性 （晶体 MD 分析）
6. 材料力学性能计算 （体相材料弹性常数和断裂分析）

8.三维体相能带结构及其态密度分布计算（晶体 band 和 dos 计算）
9. 光学性质计算 （平面氮化硼和立方氮化硼的对比分析）

10.表面模型搭建，表面吸附模型等（二维石材料吸附计算）

11. 高通量计算，机器学习和pymatgen软件简介

六、课堂互动及答疑

1.分组讨论
2.专题技术讨论
3.课后技术指导
4.综合计算练习