2019全国TCGA,GEO生信高通量数据挖掘专题学习班（4月北京班）_门票优惠

【会议内容】

培训简介：

癌症是临床医学中非常重要的疾病方向。TCGA 数据库中包含了常见了40种癌症方向（含30000个样本）的高通量数据及临床信息。大家对TCGA数据库的使用近几年也在逐渐增加！如图1所示。

2019全国TCGA,GEO生信高通量数据挖掘专题学习班（4月北京班）

图1 基于 pubmed数据库检索的包含“TCGA”发表的SCI 文章数量（2018年11月7日）

关键靶标分析是指基于生信的方法从高通量数据中挖掘到与研究方向最相关的靶标基因（mRNA，miRNA，lncRNA或蛋白）。

因此，需要我们自己掌握高通量数据挖掘的能力以及逻辑性的生信分析思路，从海量信息中获得自己想要的关键基因！

培训预期：

1. 通过整整两天的培训，掌握TCGA，GEO数据库的使用、下载及分析思路和实用操作知识点。

2. 可以独立完成一篇基于公共数据库的高通量数据挖掘分析。

3. 课后还可以赠送1小时的全场串联视频，用于学员的复习。

4. 赠送一份最近5年的高价值国自然标书（医药加高价值标书库里面选择）

5. 讲师团队赠送TCGA数据库甲基化，基因表达谱整合分析报告与疾病mRNA+lncRNA分析报告

学习班组织方

主办方：医药加科研培训中心

承办方：上海遐永医药科技有限公司

【会议日程】

TCGA&GEO高通量数据挖掘分析班课表
日期	时间	课程安排	内容介绍
第一天上午	9:00-10:00	生信简介	生物信息介绍
			高通量：测序及芯片介绍——多组学：转录组学、基因组学、表观组学、宏基因组学等
			经典生信SCI文章的思路解读，了解TCGA数据库、GEO数据库及高通量测序数据的挖掘获得创新结论并发文章的思路
	10:00-10:15	茶歇
	10:15-12:00	TCGA数据库 NCBI GEO数据库	TCGA数据库：最全的癌症高通量数据公共库(简介)
			TCGA数据库的产生过程
			TCGA官方数据库的介绍和使用（包含了转录组、基因组、表观组和临床信息数据）
			GEO数据库介绍及使用：高通量芯片数据查找、筛选、探针转换、差异分析等。
	12:00-13:30	午餐及午休
第一天下午	13:30-15:00	TCGA相关下载工具	TCGA数据库据下载：RNA-seq数据、miRNA-seq数据、甲基化数据、基因组数据及临床信息数据的下载TCGA数据书库癌症数据的处理，获得关键mRNA、miRNA的表达谱矩阵。
	15:00-15:20	茶歇
	15:20-17:00	TCGA相关分析工具	TCGA数据分析——突变分析、差异分析、关联分析、生存分析、miRNA调控靶基因分析等。
			获得生存曲线图（KM曲线，分为临床因素和基因表达两种KM曲线）

第二天上午	8:30-10:30	TCGA数据后续高级分析工具实战	功能富集分析——GO富集和KEGG pathway富集分析
			聚类热图制作
	10:30-10:45	茶歇
	10:45-12:00	TCGA数据后续高级分析工具实战	蛋白互作分析（PPI）及网络图构建
			网络分析及hub蛋白/基因获得。
	12:00-13:30	午餐及午休
周日下午	13:30-15:00	TCGA数据库与GEO数据库挖掘	基于TCGA的lncRNA-miRNA-mRNA全转录组整合分析思路演练基于TCGA的甲基化与转录组整合分析思路演练基于GEO数据库多套数据整合（meta）分析思路演练
	15:00-15:20
	15:20-16:30	整体演练并录屏	在电脑上快速完成从头到尾的一套数据实战，及答疑
注意事项：学员需自己带电脑，要求为windows系统，现场不得录音录像，上课所用软件为cytoscape和Heml