2018微生物组学研究及数据分析专题培训班
时间：2018-05-07 08:00 至 2018-05-11 18:00
地点：北京
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2018微生物组学研究及数据分析专题培训班 已截止报名会议时间： 2018-05-07 08:00至 2018-05-11 18:00结束 会议地点： 北京 中电华软大厦 北京海淀区上地农大南路33号 周边酒店预订 会议规模：50人 主办单位： 北京路思达生物信息科技有限公司 |
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会议内容 主办方介绍
2018微生物组学研究及数据分析专题培训班宣传图
北京路思达生物信息科技有限公司
北京路思达生物信息科技有限公司成立于2010年。我们致力于为您提供最优质的生物信息学分析软件及生物类数据库，主要产品有生物通路分析软件（Ingenuity Pathway Analysis, IPA）、人类基因突变数据库（Human Gene Mutation Database, HGMD）、变异分析软件（Ingenuity Variants Analysis, IVA），以及CLC Bio系列的二代测序数据分析软件（Genomics Workbench、Biomedical Genomics Workbench…）等。 此外，公司在深入调研的基础上，迎合高校及科研院所的科研工作者在科研思路的扩展、科研技术及方法的更新等方面的需求，推出了旨在为解决科研工作者在基因组、转录组、泛基因组、宏基因组等科研项目中的科研难题的《二代测序与NGS数据分析》、《转录组研究策略及RNA-seq数据分析》、《宏基因组与数据分析》等专题培训课程。理论课程由担任国家973计划首席科学家、国家自然科学基金重点专项负责人等多位研究员亲自授课，上机课程则由实践经验丰富的一线科研人员带领学员亲自实践。课程自推出以来获得极大好评。
会议日程
（最终日程以会议现场为准）
2018.05.08 2018.05.09 2018.05.10 2018.05.11
5月8日 上午 (理论)
1．微生物组学研究趋势与方法
1.1 单菌不同水平（如DNA、RNA、蛋白等）的研究趋势和方法
1.2 如何利用这些组学研究成果
2.序列组装和功能分析——DNA水平
2.1 如何利用和比较不同测序平台数据在序列组装上的优缺点
2.2 如何利用Sanger测序的结果进行PCR补洞
2.3 基于组装好的序列进行组分（基因、功能元件、非编码RNA等）和功能分析
2.4 微生物分析内容和方法
2.5讨论如何联合DNA和RNA分析结果形成真正的trans研究
3.微生物基因组与转录组学研究
3.1 微生物基因组研究的意义、概况和特点
3.2 微生物转录组学研究概况
5月8日 下午（上机）
Linux系统操作简介
1. Linux简史
2. Linux与生物信息学
3. Linux基本命令
4. Linux基本操作综合实践
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5月9日 上午 (上机)
细菌基因组常规分析流程
1. 原始数据评估
2. 基因组拼接、注释
3. 功能注释
4. 进化树分析
5. 多菌株泛基因组分析
5月9日 下午 （上机）
Python编程语言简介
1. Python安装
2. Python基本语法
3. Python文件读取、文件输出
4. Python在生物信息中的实践
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5月10日 上午 (理论)
微生物宏基因组
1. 16S rDNA AMPLICON SEQUENCING 法
1.1 测序平台、引物设计及区域选择（针对细菌、真菌不同微生物进行实验设计）
1.2 测序量及采样建议（针对水体、粪便、土壤、物体表面、口腔等不同生境）
1.3 分析流程图（数据收集、数据预处理、数据分析）
1.4 结果解析：OTU聚类、序列比对、构建进化树、物种注释、物种分布情况、样品复杂度分析（α多样性）、Coverage、Chao指数、ACE指数、Shannon曲线、Richness rarefaction曲线、多样品比较分析（β多样性）、样品间物种丰度热图、排序分析、PCA分析、PCoA分析、NMDS分析、Unifrac分析、样品聚类分析
2. DSS （direct shotgun sequencing）法
2.1 分析流程（序列质量控制——fastqc、序列拼接、基因预测及丰度分析、物种注释、功能注释）
2.2 功能注释分析
2.3 代谢途径解析
3. MetaSPAdes、MEGAN、metAMOS等软件介绍
5月10日 下午 （上机）
宏基因组学实践应用：针对16S rDNA amplicon sequencing分析
1. 虚拟机安装：Virtual Box
2. 16S分析运行环境搭建：QIIME Virtual Machine
3. 实例演示及结果展示：数据预处理、OTU聚类、物种注释、OTU Table生成、α 多样性序列比对、构建进化树、β多样性
宏基因组学实践应用：针对shotgun sequencing分析(只做流程演示讲解)
1. 序列质量控制——fastqc
2. 序列拼接
3. 基因预测及丰度分析
4. 物种注释、功能注释
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5月11日 上午 (理论)
宏转录组学
1. 宏转录组介绍
2. 物种组成、功能及代谢途径分析
5月11日 下午 （上机）
perl语言在微生物基因组分析中的应用
1. perl入门
1.1 perl语言简介
1.2 基本操作
1.3 控制结构
1.4 模式匹配
2. perl语言操作综合实践
2.1 基因组拼接质量评估
2.2 测序深度和覆盖度计算
2.3 scaffold序列处理等
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会议嘉宾
（最终出席嘉宾以会议现场为准）
主讲人：胡松年
博导，中科院基因组科学与信息重点实验室主任
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参会指南
温馨提示
酒店与住宿:
为防止极端情况下活动延期或取消，建议“异地客户”与活动家客服确认参会信息后，再安排出行与住宿。
退款规则:
活动各项资源需提前采购，购票后不支持退款，可以换人参加。
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