上海交通大学生命科学技术学院微生物学特聘教授，微生物分子生态学与生态基因组学实验室主任，上海系统生物医学研究中心营养系统生物学实验室主任，上海交大－完美中国微生态健康联合研究中心主任。1989年南京农业大学博士毕业。1993-1995康奈尔大学访问学者。2004－2012担任上海交通大学生命科学技术学院副院长。2005-2009，上海系统生物医学研究中心常务副主任。2009年度上海市优秀学科带头人。2006－2012担任国际微生物生态学会（ISME）常务理事。 Journal of Molecular Medicine，FEMS Microbiology Ecology，Microbial Biotechnology等国际刊物编委；ISME Journal（国际微生物生态学会会刊，影响因子9.3）的资深编辑，Scientific Report编委。2014年被选为美国微生物科学院院士。 他领导的团队是国际知名的微生物分子生态学研究小组，在复杂微生物群落结构分析技术和统计计算方法、结构与功能相关性、功能细菌分离及机制研究等方面做了很多创新性工作，特别在肠道菌群与肥胖等代谢性疾病的关系研究中，提出“代谢性疾病的肠源性学说”，发现并验证了首例能够引起肥胖症的人体肠道细菌。在美国科学院院报（PNAS）, 国际微生物生态学会会刊（ISME Journal）、Nature Communications、Nature Reviews Microbiology, EBioMedicine等刊物发表论文四十余篇。应邀在国际微生物生态学大会、国际人类微生物组大会、国际糖尿病技术大会、美国微生物学会年会等一系列国际会议做大会报告、特邀报告。目前的研究重点是，营养如何通过改变菌群从而影响代谢性疾病的发生和发展，以及如何挖掘、利用中国传统养生食材和中医药中的有效成分，通过调理菌群结构进行肥胖、糖尿病等代谢性疾病的预防和治疗。2012年6月，美国《科学》周刊曾对他的研究工作做过专题报道(Science 336: 1248)。