医学寄生虫分会是在中华预防医学会领导下的全国性医学寄生虫学专业学术团体。 根据中华预防医学会章程的规定并结合分会的特点，分会的宗旨为：团结组织全国广大的医学寄生虫学工作者，面向现代化、面向世界、面向未来和面向社会，促进科学技术的繁荣发展和普及、推广，促进人才的成长和提高，以更好地服务于寄生虫病的防制工作，为提高整个中华民族的体质，为推动我国两个文明建设做出贡献。
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