首页>商务会议>农林牧渔> 青岛——基因组、转录组、生物信息学数据分析培训班 发布时间:2017-12-25T09:32:21

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青岛——基因组、转录组、生物信息学数据分析培训班
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青岛——基因组、转录组、生物信息学数据分析培训班

会议时间:2018-01-26 08:00至 2018-01-29 18:00结束

会议地点:青岛  青岛大学  南区宁夏路308号

会议规模:30人

发票类型:增值税普通发票
领取方式:现场领取 
发票内容:培训费 会议费 材料费等 
参会凭证:现场凭电话姓名参会 听课证
退款说明: 支持退款 报道前5个工作日,均可全额退款。

门票名称截止时间单价数量
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参会人信息







会议通知 会议内容 主办方介绍


青岛——基因组、转录组、生物信息学数据分析培训班

青岛——基因组、转录组、生物信息学数据分析培训班宣传图

一、培训目标及特点:

本培训以第三代测序、第四代测序技术的应用与数据分析、基因组、转录组为主题,精心设计了具有前沿性、实用性和针对性强的理论课程和上机实操课程。培训邀请的主讲人均是有理论和实际研究经验的人员,学员通过与专家直接交流能够分享到这些顶尖学术机构的研究经验和实验设计思路。学员通过集中专题学习后能够扩展思路,在研究技术方面领悟更多。


二、培训内容

    章节

   内 容

生物信息学介绍 

生物信息学介绍与前沿技术动态

序列的比对

1、全局比对  Clustalw,Muscle,Hmmer

2、局部比对  Blast, Sim4,Genewise

3、序列比对算法分析



基因组/基因注释分析

1、新一代测序技术原理和数据处理介绍

2、基因组拼接与组装

基因组de novo组装方法

重复序列分析技术

3、 RNA分析
tRNA,rRNA,microRNA,snoRNA

RNA干扰,SiRNA预测技术
4、基因预测
原核:Glimmer,真核:Genescan, Augustus
5、 基因功能注释及常用的数据库介绍

基因组学研究概述


1、structural genomics: 结构基因组学

2、functional genomics: 功能基因组学

3、Drug discovery: 药物研发

4、Personalized medicine:个性化、精细医疗


DNA测序技术-转录组分析的进化

1、第一代测序技术:Sanger测序原理

2、第二代测序技术:Illumina,454, Ion Torrent原理

3、第三代测序技术:PacBio, Hellicos原理

4、第四代测序技术: Oxford NanoPore原理

5、其他技术Hybridization based methods (NabSys)

Experimental   procedure for transcriptomic analysis

Introduction

Number of duplications

Sequencing coverage

Transcriptomic analysis using NGS (RNA-Seq)

Transcriptomic analysis using PacBio (Iso-Seq)

IsoSeq Experimental design

Data analysis  (part 1):data pre-processing


evaluation of data quality 数据分析

Data format,fasta,fastq,quality value,gff3 Data cleanup

Quality filter, trimmer, clipper


Data analysis (part 2):reference free analyses(无参转录组分析)

Gene discovery

Trinity de novo transcriptome assembly

Analysis of Differential Expressed Gene (DEGs)

Abundance estimation using RSEM

Differential expression analysis using EdgeR

Explore the results (cummerbund)

MA plot, Volcano plot, False Discovery Rate (FDR)

hierarchical two-way clustering, pairwise sample-distance, gene expression profiles.


使用R语言进行生物信息学相关的分析

使用R语言相关的包对转录组等组学的高通量测序数据进行差异表达、富集分析等。

生物信息学专业图KEGG、GO等的绘制方法与运用R语言进行实现

基因组可视化软件circos的使用


使用circos绘制基因组圈图

生物信息学专业常用工具及绘图方法

应用生物信息常用的工具进行专业绘图及格式转换;

学BioEdit、WeGO等常用生物学专业软件的图表及格式转换

查看更多

中国科学院计算技术研究所 烟台分所 中国科学院计算技术研究所 烟台分所

中科院计算技术研究所烟台分所(烟台分所)是中国科学院计算技术研究所与烟台高新技术产业开发区共同组建的网络应用技术研究机构,定位为将国家战略需求和地方产业需求紧密结合的新型研究所。是中科院计算所第一个将技术整体转移并实现资源共享、信息互通的地方分支机构。明确“一个方向”:以海量互联网数据的深度信息处理为主要发展方向。建设“三大平台”:海量网络数据计算平台,大规模网络仿真平台,互联网深度信息服务。产出“三类价值”:学术、系统和应用、产业孵化。

北京中科云畅应用技术研究院

会议日程

即将更新,敬请期待

会议嘉宾

即将更新,敬请期待

参会指南 会议门票 场馆介绍


报名费3900/人,团体报名5人,可赠送1个名额。

查看更多

青岛大学 青岛大学

交通指南:

南区宁夏路308号

青岛大学(Qingdao University),简称“青大”(QDU),位于山东省青岛市,是山东省属重点综合大学,入选国家“111计划”,山东省与青岛市共建高校,教育部“卓越工程师教育培养计划”、“卓越医生教育培养计划”改革试点高校,教育部来华留学示范基地建设高校,中国政府奖学金来华留学生接收院校,山东省首批应用基础型人才培养特色名校建设单位,设有国家大学生文化素质教育基地和国家华文教育基地。

学校是1993年由原青岛大学、青岛医学院、山东纺织工学院、青岛师范专科学校合并组建而成。2015年顺利通过教育部本科教学工作审核评估。


标签: 农业 林业 畜牧业 生物技术 养猪 水产养殖

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部分参会单位

主办方没有公开参会单位

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