会议介绍
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日期 |
时间 |
授课题目 |
授课内容 |
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第一天 |
09:30-10:00 |
生物信息学与Perl语言概述 |
概括介绍生物信息学背景与Perl语言的概念及特点 |
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10:00-10:20 |
软件安装与运行环境调试 |
Perl语言解释器、编辑器安装,Perl程序运行测试 |
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10:20-12:00 |
基本操作与基本概念 |
DOS、Unix命令行操作基本命令;Perl语言基本变量与操作符;基本变量、字符串赋值、基本运算等 |
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13:30-16:30 |
基本语法结构、文件与文件夹操作 |
判断结构;循环结构;文件的读入与输出;文件夹操作 |
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第二天 |
09:30-12:00 |
数组、二维数组、hash表及应用 |
数组的概念及用法; 二维数组概念与应用; 关联数组(hash表)的用法; |
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13:30-16:30 |
函数、子程序、正则表达式 |
常用函数学习; 子程序概念与应用; 正则表达式的应用; |
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第三天 |
09:30-11:00 |
生物信息学Perl程序实例与应用 |
常用生物信息学数据库及专业软件应用简介; 二代测序数据分析; 生物信息学实用程序; |
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11:00-12:00 |
CAPN与Bioperl简介、Bioperl的安装 |
Perl模块安装、包与引用简介; Perl第三方代码库CPAN的简介与应用; Bioperl简介与安装; |
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13:30-16:30 |
Bioperl的基本应用 |
文件读取与格式转换; 生物学数据自动化批量下载; 序列信息统计与分析 |
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第四天 |
09:30-12:00 |
Bioperl应用进阶学习 |
GenBank基因组文件特定信息提取; 序列自动化比对; 进化距离计算; |
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13:30-16:00 |
数据可视化与做图等 |
Perl语言做图; 基因组信息图形化展示; Perl的外界调用与整合应用; Perl面向对向编程序 |
(此表仅供参考,授课内容以实际授课为准)
【会议门票】收费标准
注册费:3000元/人(含听课费、资料费、上机费、午餐,请自带笔记本电脑以备上机实践使用),住宿费用自理。
报名优惠政策
1、3人以上团体报名每人可减少400元;
2、4+1团报,可免费赠送一个名额;
3、上面3种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种;
培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。
【会议通知】Perl语言作为绝大多数生物信息学工作者首选语言之一。北京市计算中心生物计算事业部针对没有任何计算机语言的生物学、医学、农学等人员,且有从事生物信息学工作相关研究工作的需要。欢迎您报名参加!
培训特色
1、对口生物信息; 2、非严格语法,适合初学;
3、功能强大、跨平台;4、有巨大的第三方代码库CPAN
主办单位:北京市计算中心,生物计算事业部
举办地点:北京,北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼
培训时间:第九期2015年8月2日-5日

